Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUP62P37198 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUP62P37198 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUP62P37198 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUP62P37198 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP62P37198 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP62P37198 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP62P37198 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP62P37198 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP62P37198 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP62P37198 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP62P37198 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP62P37198 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUP62P37198 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUP62P37198 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUP62P37198 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUP62P37198 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUP62P37198 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUP62P37198 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NUP62P37198 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUP62P37198 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUP62P37198 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUP62P37198 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUP62P37198 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUP62P37198 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUP62P37198 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUP62P37198 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUP62P37198 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUP62P37198 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUP62P37198 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUP62P37198 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUP62P37198 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUP62P37198 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUP62P37198 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUP62P37198 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUP62P37198 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUP62P37198 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP62P37198 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP62P37198 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP62P37198 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP62P37198 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP62P37198 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP62P37198 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP62P37198 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP62P37198 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NUP62P37198 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NUP62P37198 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NUP62P37198 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NUP62P37198 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NUP62P37198 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NUP62P37198 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NUP62P37198 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NUP62P37198 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NUP62P37198 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NUP62P37198 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NUP62P37198 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NUP62P37198 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NUP62P37198 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NUP62P37198 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NUP62P37198 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NUP62P37198 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NUP62P37198 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NUP62P37198 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUP62P37198 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUP62P37198 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUP62P37198 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUP62P37198 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUP62P37198 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUP62P37198 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NUP62P37198 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NUP62P37198 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NUP62P37198 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NUP62P37198 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NUP62P37198 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
NUP62P37198 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NUP62P37198 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NUP62P37198 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NUP62P37198 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NUP62P37198 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NUP62P37198 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NUP62P37198 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NUP62P37198 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NUP62P37198 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NUP62P37198 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NUP62P37198 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NUP62P37198 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NUP62P37198 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NUP62P37198 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NUP62P37198 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NUP62P37198 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NUP62P37198 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NUP62P37198 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NUP62P37198 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUP62P37198 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUP62P37198 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUP62P37198 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUP62P37198 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUP62P37198 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUP62P37198 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUP62P37198 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms