Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHI3L1P36222 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHI3L1P36222 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHI3L1P36222 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHI3L1P36222 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CHI3L1P36222 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHI3L1P36222 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CHI3L1P36222 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHI3L1P36222 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHI3L1P36222 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHI3L1P36222 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHI3L1P36222 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHI3L1P36222 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHI3L1P36222 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHI3L1P36222 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHI3L1P36222 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHI3L1P36222 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHI3L1P36222 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHI3L1P36222 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHI3L1P36222 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHI3L1P36222 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHI3L1P36222 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHI3L1P36222 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHI3L1P36222 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHI3L1P36222 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHI3L1P36222 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHI3L1P36222 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHI3L1P36222 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHI3L1P36222 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHI3L1P36222 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHI3L1P36222 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHI3L1P36222 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHI3L1P36222 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHI3L1P36222 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHI3L1P36222 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHI3L1P36222 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CHI3L1P36222 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CHI3L1P36222 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CHI3L1P36222 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CHI3L1P36222 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CHI3L1P36222 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CHI3L1P36222 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CHI3L1P36222 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CHI3L1P36222 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CHI3L1P36222 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHI3L1P36222 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHI3L1P36222 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHI3L1P36222 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHI3L1P36222 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHI3L1P36222 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHI3L1P36222 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHI3L1P36222 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHI3L1P36222 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHI3L1P36222 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CHI3L1P36222 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHI3L1P36222 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHI3L1P36222 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHI3L1P36222 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHI3L1P36222 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHI3L1P36222 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHI3L1P36222 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHI3L1P36222 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHI3L1P36222 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHI3L1P36222 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHI3L1P36222 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHI3L1P36222 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHI3L1P36222 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHI3L1P36222 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHI3L1P36222 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHI3L1P36222 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CHI3L1P36222 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CHI3L1P36222 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CHI3L1P36222 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHI3L1P36222 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHI3L1P36222 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHI3L1P36222 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHI3L1P36222 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHI3L1P36222 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHI3L1P36222 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CHI3L1P36222 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHI3L1P36222 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHI3L1P36222 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHI3L1P36222 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHI3L1P36222 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHI3L1P36222 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHI3L1P36222 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHI3L1P36222 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHI3L1P36222 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHI3L1P36222 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHI3L1P36222 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHI3L1P36222 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHI3L1P36222 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHI3L1P36222 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHI3L1P36222 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHI3L1P36222 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHI3L1P36222 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHI3L1P36222 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHI3L1P36222 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHI3L1P36222 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHI3L1P36222 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms