Protein–RNA interactions for Protein: P35900

KRT20, Keratin, type I cytoskeletal 20, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT20P35900 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT20P35900 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT20P35900 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT20P35900 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT20P35900 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT20P35900 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT20P35900 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT20P35900 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT20P35900 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT20P35900 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT20P35900 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT20P35900 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT20P35900 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT20P35900 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT20P35900 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT20P35900 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT20P35900 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT20P35900 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT20P35900 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT20P35900 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT20P35900 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT20P35900 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT20P35900 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT20P35900 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT20P35900 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT20P35900 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT20P35900 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT20P35900 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT20P35900 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT20P35900 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT20P35900 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT20P35900 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT20P35900 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT20P35900 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT20P35900 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT20P35900 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT20P35900 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT20P35900 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT20P35900 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT20P35900 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT20P35900 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT20P35900 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT20P35900 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT20P35900 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT20P35900 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT20P35900 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT20P35900 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT20P35900 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT20P35900 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT20P35900 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT20P35900 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT20P35900 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT20P35900 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT20P35900 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT20P35900 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT20P35900 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT20P35900 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT20P35900 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT20P35900 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT20P35900 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT20P35900 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT20P35900 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT20P35900 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT20P35900 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT20P35900 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT20P35900 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT20P35900 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT20P35900 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT20P35900 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT20P35900 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT20P35900 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT20P35900 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT20P35900 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT20P35900 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT20P35900 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT20P35900 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT20P35900 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT20P35900 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT20P35900 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT20P35900 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT20P35900 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT20P35900 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT20P35900 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT20P35900 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT20P35900 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT20P35900 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT20P35900 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT20P35900 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT20P35900 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT20P35900 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT20P35900 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT20P35900 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT20P35900 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT20P35900 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT20P35900 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT20P35900 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT20P35900 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT20P35900 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT20P35900 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT20P35900 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.7 ms