Protein–RNA interactions for Protein: P35523

CLCN1, Chloride channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN1P35523 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLCN1P35523 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLCN1P35523 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLCN1P35523 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLCN1P35523 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLCN1P35523 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLCN1P35523 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLCN1P35523 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CLCN1P35523 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLCN1P35523 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLCN1P35523 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLCN1P35523 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLCN1P35523 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CLCN1P35523 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLCN1P35523 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLCN1P35523 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLCN1P35523 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLCN1P35523 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLCN1P35523 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLCN1P35523 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLCN1P35523 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLCN1P35523 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CLCN1P35523 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLCN1P35523 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLCN1P35523 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLCN1P35523 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLCN1P35523 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLCN1P35523 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLCN1P35523 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLCN1P35523 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLCN1P35523 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLCN1P35523 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLCN1P35523 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLCN1P35523 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLCN1P35523 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLCN1P35523 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLCN1P35523 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CLCN1P35523 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CLCN1P35523 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CLCN1P35523 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLCN1P35523 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLCN1P35523 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLCN1P35523 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLCN1P35523 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLCN1P35523 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLCN1P35523 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLCN1P35523 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLCN1P35523 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CLCN1P35523 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLCN1P35523 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLCN1P35523 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLCN1P35523 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLCN1P35523 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLCN1P35523 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLCN1P35523 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLCN1P35523 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLCN1P35523 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLCN1P35523 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLCN1P35523 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLCN1P35523 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLCN1P35523 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLCN1P35523 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLCN1P35523 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLCN1P35523 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CLCN1P35523 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLCN1P35523 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLCN1P35523 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLCN1P35523 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLCN1P35523 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLCN1P35523 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLCN1P35523 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLCN1P35523 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLCN1P35523 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLCN1P35523 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLCN1P35523 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLCN1P35523 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLCN1P35523 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLCN1P35523 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLCN1P35523 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CLCN1P35523 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLCN1P35523 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLCN1P35523 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLCN1P35523 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLCN1P35523 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLCN1P35523 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLCN1P35523 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLCN1P35523 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLCN1P35523 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLCN1P35523 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLCN1P35523 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLCN1P35523 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLCN1P35523 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLCN1P35523 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLCN1P35523 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLCN1P35523 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLCN1P35523 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLCN1P35523 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLCN1P35523 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
CLCN1P35523 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLCN1P35523 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms