Protein–RNA interactions for Protein: P35408

PTGER4, Prostaglandin E2 receptor EP4 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER4P35408 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGER4P35408 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGER4P35408 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGER4P35408 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTGER4P35408 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTGER4P35408 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTGER4P35408 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGER4P35408 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGER4P35408 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGER4P35408 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGER4P35408 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGER4P35408 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGER4P35408 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTGER4P35408 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTGER4P35408 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTGER4P35408 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTGER4P35408 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTGER4P35408 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTGER4P35408 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTGER4P35408 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTGER4P35408 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTGER4P35408 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTGER4P35408 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTGER4P35408 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTGER4P35408 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTGER4P35408 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTGER4P35408 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTGER4P35408 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTGER4P35408 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTGER4P35408 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTGER4P35408 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGER4P35408 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGER4P35408 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGER4P35408 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGER4P35408 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PTGER4P35408 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGER4P35408 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGER4P35408 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGER4P35408 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGER4P35408 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGER4P35408 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGER4P35408 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGER4P35408 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGER4P35408 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGER4P35408 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGER4P35408 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGER4P35408 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGER4P35408 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGER4P35408 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGER4P35408 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGER4P35408 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGER4P35408 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGER4P35408 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGER4P35408 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGER4P35408 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGER4P35408 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGER4P35408 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGER4P35408 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGER4P35408 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGER4P35408 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGER4P35408 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGER4P35408 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGER4P35408 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGER4P35408 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGER4P35408 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGER4P35408 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGER4P35408 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGER4P35408 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGER4P35408 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGER4P35408 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGER4P35408 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGER4P35408 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGER4P35408 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGER4P35408 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER4P35408 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER4P35408 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER4P35408 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER4P35408 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER4P35408 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER4P35408 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER4P35408 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGER4P35408 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGER4P35408 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGER4P35408 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGER4P35408 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGER4P35408 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGER4P35408 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGER4P35408 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGER4P35408 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGER4P35408 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGER4P35408 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGER4P35408 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGER4P35408 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGER4P35408 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGER4P35408 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGER4P35408 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGER4P35408 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGER4P35408 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGER4P35408 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGER4P35408 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 522.9 ms