Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RFC1P35251 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RFC1P35251 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RFC1P35251 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RFC1P35251 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RFC1P35251 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RFC1P35251 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RFC1P35251 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RFC1P35251 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RFC1P35251 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RFC1P35251 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RFC1P35251 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RFC1P35251 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RFC1P35251 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RFC1P35251 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RFC1P35251 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RFC1P35251 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RFC1P35251 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RFC1P35251 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RFC1P35251 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RFC1P35251 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RFC1P35251 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RFC1P35251 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RFC1P35251 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RFC1P35251 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RFC1P35251 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RFC1P35251 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RFC1P35251 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RFC1P35251 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
RFC1P35251 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
RFC1P35251 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RFC1P35251 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RFC1P35251 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RFC1P35251 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RFC1P35251 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RFC1P35251 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RFC1P35251 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RFC1P35251 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RFC1P35251 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RFC1P35251 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RFC1P35251 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RFC1P35251 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RFC1P35251 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RFC1P35251 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RFC1P35251 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RFC1P35251 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RFC1P35251 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RFC1P35251 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RFC1P35251 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RFC1P35251 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RFC1P35251 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RFC1P35251 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RFC1P35251 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RFC1P35251 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RFC1P35251 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RFC1P35251 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RFC1P35251 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RFC1P35251 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RFC1P35251 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RFC1P35251 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RFC1P35251 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RFC1P35251 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RFC1P35251 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RFC1P35251 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RFC1P35251 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RFC1P35251 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RFC1P35251 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RFC1P35251 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RFC1P35251 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RFC1P35251 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RFC1P35251 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RFC1P35251 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RFC1P35251 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RFC1P35251 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RFC1P35251 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RFC1P35251 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RFC1P35251 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFC1P35251 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFC1P35251 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFC1P35251 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFC1P35251 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFC1P35251 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RFC1P35251 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RFC1P35251 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RFC1P35251 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RFC1P35251 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RFC1P35251 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RFC1P35251 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RFC1P35251 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFC1P35251 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFC1P35251 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFC1P35251 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RFC1P35251 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RFC1P35251 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RFC1P35251 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RFC1P35251 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RFC1P35251 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RFC1P35251 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RFC1P35251 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RFC1P35251 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms