Protein–RNA interactions for Protein: P33993

MCM7, DNA replication licensing factor MCM7, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM7P33993 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MCM7P33993 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MCM7P33993 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MCM7P33993 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MCM7P33993 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MCM7P33993 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MCM7P33993 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MCM7P33993 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MCM7P33993 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MCM7P33993 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MCM7P33993 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MCM7P33993 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MCM7P33993 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MCM7P33993 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MCM7P33993 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MCM7P33993 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MCM7P33993 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MCM7P33993 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MCM7P33993 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MCM7P33993 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MCM7P33993 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCM7P33993 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCM7P33993 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCM7P33993 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCM7P33993 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCM7P33993 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCM7P33993 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCM7P33993 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCM7P33993 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCM7P33993 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCM7P33993 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCM7P33993 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MCM7P33993 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MCM7P33993 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MCM7P33993 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MCM7P33993 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MCM7P33993 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MCM7P33993 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MCM7P33993 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
MCM7P33993 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCM7P33993 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
MCM7P33993 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCM7P33993 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCM7P33993 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCM7P33993 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCM7P33993 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCM7P33993 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCM7P33993 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCM7P33993 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCM7P33993 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCM7P33993 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCM7P33993 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCM7P33993 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MCM7P33993 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MCM7P33993 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MCM7P33993 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MCM7P33993 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MCM7P33993 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MCM7P33993 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MCM7P33993 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MCM7P33993 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MCM7P33993 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCM7P33993 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCM7P33993 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
MCM7P33993 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCM7P33993 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MCM7P33993 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MCM7P33993 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MCM7P33993 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MCM7P33993 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MCM7P33993 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MCM7P33993 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MCM7P33993 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MCM7P33993 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
MCM7P33993 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MCM7P33993 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MCM7P33993 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MCM7P33993 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MCM7P33993 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
MCM7P33993 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCM7P33993 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCM7P33993 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCM7P33993 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCM7P33993 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCM7P33993 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MCM7P33993 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MCM7P33993 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MCM7P33993 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MCM7P33993 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MCM7P33993 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MCM7P33993 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MCM7P33993 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MCM7P33993 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MCM7P33993 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MCM7P33993 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MCM7P33993 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MCM7P33993 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MCM7P33993 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MCM7P33993 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
MCM7P33993 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms