Protein–RNA interactions for Protein: P33121

ACSL1, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL1P33121 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACSL1P33121 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACSL1P33121 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACSL1P33121 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ACSL1P33121 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACSL1P33121 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACSL1P33121 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ACSL1P33121 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACSL1P33121 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACSL1P33121 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACSL1P33121 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACSL1P33121 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACSL1P33121 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACSL1P33121 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACSL1P33121 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACSL1P33121 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACSL1P33121 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ACSL1P33121 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACSL1P33121 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACSL1P33121 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACSL1P33121 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACSL1P33121 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACSL1P33121 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACSL1P33121 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACSL1P33121 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACSL1P33121 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACSL1P33121 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACSL1P33121 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACSL1P33121 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACSL1P33121 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ACSL1P33121 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACSL1P33121 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACSL1P33121 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACSL1P33121 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACSL1P33121 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACSL1P33121 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACSL1P33121 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACSL1P33121 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ACSL1P33121 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACSL1P33121 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACSL1P33121 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACSL1P33121 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACSL1P33121 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ACSL1P33121 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACSL1P33121 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACSL1P33121 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACSL1P33121 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACSL1P33121 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACSL1P33121 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACSL1P33121 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACSL1P33121 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACSL1P33121 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACSL1P33121 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACSL1P33121 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACSL1P33121 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ACSL1P33121 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACSL1P33121 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACSL1P33121 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACSL1P33121 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACSL1P33121 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACSL1P33121 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACSL1P33121 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACSL1P33121 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACSL1P33121 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACSL1P33121 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACSL1P33121 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACSL1P33121 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACSL1P33121 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACSL1P33121 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACSL1P33121 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACSL1P33121 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ACSL1P33121 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACSL1P33121 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACSL1P33121 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACSL1P33121 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACSL1P33121 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACSL1P33121 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACSL1P33121 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACSL1P33121 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACSL1P33121 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ACSL1P33121 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACSL1P33121 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACSL1P33121 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACSL1P33121 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACSL1P33121 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ACSL1P33121 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACSL1P33121 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACSL1P33121 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACSL1P33121 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ACSL1P33121 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACSL1P33121 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACSL1P33121 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACSL1P33121 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACSL1P33121 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACSL1P33121 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACSL1P33121 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACSL1P33121 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACSL1P33121 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACSL1P33121 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACSL1P33121 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms