Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTX2P32243 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTX2P32243 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTX2P32243 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTX2P32243 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTX2P32243 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTX2P32243 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTX2P32243 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTX2P32243 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTX2P32243 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
OTX2P32243 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTX2P32243 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTX2P32243 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
OTX2P32243 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
OTX2P32243 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTX2P32243 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTX2P32243 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTX2P32243 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTX2P32243 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTX2P32243 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTX2P32243 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTX2P32243 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTX2P32243 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTX2P32243 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTX2P32243 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTX2P32243 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTX2P32243 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTX2P32243 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTX2P32243 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTX2P32243 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTX2P32243 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
OTX2P32243 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTX2P32243 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTX2P32243 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTX2P32243 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTX2P32243 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTX2P32243 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTX2P32243 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTX2P32243 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTX2P32243 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTX2P32243 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTX2P32243 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTX2P32243 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTX2P32243 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTX2P32243 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTX2P32243 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTX2P32243 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTX2P32243 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTX2P32243 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTX2P32243 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTX2P32243 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTX2P32243 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTX2P32243 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTX2P32243 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTX2P32243 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTX2P32243 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTX2P32243 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTX2P32243 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTX2P32243 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTX2P32243 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTX2P32243 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTX2P32243 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTX2P32243 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
OTX2P32243 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTX2P32243 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTX2P32243 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTX2P32243 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
OTX2P32243 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTX2P32243 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
OTX2P32243 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTX2P32243 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTX2P32243 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTX2P32243 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTX2P32243 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
OTX2P32243 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTX2P32243 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
OTX2P32243 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTX2P32243 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
OTX2P32243 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTX2P32243 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTX2P32243 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTX2P32243 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTX2P32243 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTX2P32243 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTX2P32243 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTX2P32243 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTX2P32243 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTX2P32243 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTX2P32243 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTX2P32243 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTX2P32243 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTX2P32243 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTX2P32243 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
OTX2P32243 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTX2P32243 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTX2P32243 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTX2P32243 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTX2P32243 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTX2P32243 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTX2P32243 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms