Protein–RNA interactions for Protein: P32004

L1CAM, Neural cell adhesion molecule L1, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1CAMP32004 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
L1CAMP32004 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
L1CAMP32004 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
L1CAMP32004 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
L1CAMP32004 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
L1CAMP32004 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
L1CAMP32004 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
L1CAMP32004 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
L1CAMP32004 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
L1CAMP32004 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
L1CAMP32004 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
L1CAMP32004 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
L1CAMP32004 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
L1CAMP32004 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
L1CAMP32004 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
L1CAMP32004 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
L1CAMP32004 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
L1CAMP32004 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
L1CAMP32004 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
L1CAMP32004 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
L1CAMP32004 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
L1CAMP32004 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
L1CAMP32004 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
L1CAMP32004 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
L1CAMP32004 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
L1CAMP32004 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
L1CAMP32004 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
L1CAMP32004 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
L1CAMP32004 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
L1CAMP32004 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
L1CAMP32004 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
L1CAMP32004 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
L1CAMP32004 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
L1CAMP32004 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
L1CAMP32004 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
L1CAMP32004 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
L1CAMP32004 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
L1CAMP32004 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
L1CAMP32004 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
L1CAMP32004 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
L1CAMP32004 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
L1CAMP32004 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
L1CAMP32004 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
L1CAMP32004 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
L1CAMP32004 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
L1CAMP32004 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
L1CAMP32004 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
L1CAMP32004 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
L1CAMP32004 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
L1CAMP32004 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
L1CAMP32004 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
L1CAMP32004 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
L1CAMP32004 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
L1CAMP32004 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
L1CAMP32004 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
L1CAMP32004 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
L1CAMP32004 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
L1CAMP32004 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
L1CAMP32004 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
L1CAMP32004 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
L1CAMP32004 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
L1CAMP32004 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
L1CAMP32004 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
L1CAMP32004 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
L1CAMP32004 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
L1CAMP32004 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
L1CAMP32004 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
L1CAMP32004 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
L1CAMP32004 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
L1CAMP32004 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
L1CAMP32004 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
L1CAMP32004 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
L1CAMP32004 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
L1CAMP32004 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
L1CAMP32004 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
L1CAMP32004 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
L1CAMP32004 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
L1CAMP32004 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
L1CAMP32004 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
L1CAMP32004 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
L1CAMP32004 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
L1CAMP32004 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
L1CAMP32004 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
L1CAMP32004 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
L1CAMP32004 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
L1CAMP32004 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
L1CAMP32004 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
L1CAMP32004 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
L1CAMP32004 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
L1CAMP32004 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
L1CAMP32004 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
L1CAMP32004 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
L1CAMP32004 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
L1CAMP32004 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
L1CAMP32004 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
L1CAMP32004 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
L1CAMP32004 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
L1CAMP32004 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
L1CAMP32004 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
L1CAMP32004 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms