Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HLA-FP30511 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HLA-FP30511 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HLA-FP30511 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HLA-FP30511 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HLA-FP30511 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HLA-FP30511 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HLA-FP30511 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HLA-FP30511 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HLA-FP30511 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HLA-FP30511 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HLA-FP30511 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HLA-FP30511 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HLA-FP30511 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HLA-FP30511 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HLA-FP30511 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HLA-FP30511 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HLA-FP30511 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HLA-FP30511 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
HLA-FP30511 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HLA-FP30511 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HLA-FP30511 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HLA-FP30511 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HLA-FP30511 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HLA-FP30511 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HLA-FP30511 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HLA-FP30511 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HLA-FP30511 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HLA-FP30511 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HLA-FP30511 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HLA-FP30511 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HLA-FP30511 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HLA-FP30511 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HLA-FP30511 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HLA-FP30511 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HLA-FP30511 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HLA-FP30511 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HLA-FP30511 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLA-FP30511 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLA-FP30511 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLA-FP30511 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLA-FP30511 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLA-FP30511 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLA-FP30511 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HLA-FP30511 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLA-FP30511 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HLA-FP30511 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HLA-FP30511 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HLA-FP30511 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HLA-FP30511 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HLA-FP30511 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HLA-FP30511 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HLA-FP30511 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HLA-FP30511 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HLA-FP30511 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HLA-FP30511 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HLA-FP30511 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HLA-FP30511 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HLA-FP30511 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HLA-FP30511 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HLA-FP30511 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HLA-FP30511 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HLA-FP30511 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HLA-FP30511 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HLA-FP30511 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HLA-FP30511 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HLA-FP30511 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HLA-FP30511 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HLA-FP30511 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HLA-FP30511 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HLA-FP30511 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HLA-FP30511 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HLA-FP30511 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HLA-FP30511 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HLA-FP30511 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HLA-FP30511 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HLA-FP30511 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HLA-FP30511 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HLA-FP30511 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HLA-FP30511 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HLA-FP30511 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HLA-FP30511 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HLA-FP30511 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HLA-FP30511 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HLA-FP30511 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HLA-FP30511 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HLA-FP30511 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HLA-FP30511 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HLA-FP30511 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HLA-FP30511 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HLA-FP30511 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HLA-FP30511 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HLA-FP30511 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HLA-FP30511 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HLA-FP30511 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HLA-FP30511 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HLA-FP30511 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
HLA-FP30511 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HLA-FP30511 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HLA-FP30511 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 286 ms