Protein–RNA interactions for Protein: P29590

PML, Protein PML, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMLP29590 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PMLP29590 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PMLP29590 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PMLP29590 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PMLP29590 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PMLP29590 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PMLP29590 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PMLP29590 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PMLP29590 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PMLP29590 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PMLP29590 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PMLP29590 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PMLP29590 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PMLP29590 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PMLP29590 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PMLP29590 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PMLP29590 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PMLP29590 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PMLP29590 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PMLP29590 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PMLP29590 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PMLP29590 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PMLP29590 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PMLP29590 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PMLP29590 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PMLP29590 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PMLP29590 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PMLP29590 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PMLP29590 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PMLP29590 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PMLP29590 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PMLP29590 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PMLP29590 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PMLP29590 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PMLP29590 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PMLP29590 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PMLP29590 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PMLP29590 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PMLP29590 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PMLP29590 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PMLP29590 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PMLP29590 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PMLP29590 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PMLP29590 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PMLP29590 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PMLP29590 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PMLP29590 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PMLP29590 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PMLP29590 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PMLP29590 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PMLP29590 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PMLP29590 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PMLP29590 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PMLP29590 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PMLP29590 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PMLP29590 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PMLP29590 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PMLP29590 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PMLP29590 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PMLP29590 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PMLP29590 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PMLP29590 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PMLP29590 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PMLP29590 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PMLP29590 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PMLP29590 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PMLP29590 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PMLP29590 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PMLP29590 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PMLP29590 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PMLP29590 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PMLP29590 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PMLP29590 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PMLP29590 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PMLP29590 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PMLP29590 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PMLP29590 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PMLP29590 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PMLP29590 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PMLP29590 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PMLP29590 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PMLP29590 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PMLP29590 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PMLP29590 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PMLP29590 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PMLP29590 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PMLP29590 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PMLP29590 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PMLP29590 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PMLP29590 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PMLP29590 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PMLP29590 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PMLP29590 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PMLP29590 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PMLP29590 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PMLP29590 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PMLP29590 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PMLP29590 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PMLP29590 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PMLP29590 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms