Protein–RNA interactions for Protein: P23588

EIF4B, Eukaryotic translation initiation factor 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4BP23588 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EIF4BP23588 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EIF4BP23588 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EIF4BP23588 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EIF4BP23588 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EIF4BP23588 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EIF4BP23588 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EIF4BP23588 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EIF4BP23588 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EIF4BP23588 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EIF4BP23588 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EIF4BP23588 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EIF4BP23588 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EIF4BP23588 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
EIF4BP23588 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EIF4BP23588 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EIF4BP23588 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EIF4BP23588 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
EIF4BP23588 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EIF4BP23588 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EIF4BP23588 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
EIF4BP23588 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
EIF4BP23588 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EIF4BP23588 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EIF4BP23588 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EIF4BP23588 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EIF4BP23588 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EIF4BP23588 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EIF4BP23588 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EIF4BP23588 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EIF4BP23588 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
EIF4BP23588 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EIF4BP23588 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EIF4BP23588 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EIF4BP23588 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EIF4BP23588 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EIF4BP23588 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EIF4BP23588 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
EIF4BP23588 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EIF4BP23588 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EIF4BP23588 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EIF4BP23588 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
EIF4BP23588 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
EIF4BP23588 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EIF4BP23588 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
EIF4BP23588 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EIF4BP23588 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EIF4BP23588 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EIF4BP23588 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EIF4BP23588 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EIF4BP23588 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EIF4BP23588 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EIF4BP23588 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EIF4BP23588 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
EIF4BP23588 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EIF4BP23588 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EIF4BP23588 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EIF4BP23588 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EIF4BP23588 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EIF4BP23588 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EIF4BP23588 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EIF4BP23588 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EIF4BP23588 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EIF4BP23588 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EIF4BP23588 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
EIF4BP23588 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EIF4BP23588 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EIF4BP23588 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EIF4BP23588 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EIF4BP23588 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
EIF4BP23588 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
EIF4BP23588 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EIF4BP23588 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EIF4BP23588 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EIF4BP23588 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EIF4BP23588 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EIF4BP23588 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EIF4BP23588 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EIF4BP23588 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EIF4BP23588 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EIF4BP23588 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EIF4BP23588 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EIF4BP23588 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EIF4BP23588 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EIF4BP23588 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EIF4BP23588 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
EIF4BP23588 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EIF4BP23588 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
EIF4BP23588 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
EIF4BP23588 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
EIF4BP23588 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
EIF4BP23588 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EIF4BP23588 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EIF4BP23588 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EIF4BP23588 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EIF4BP23588 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EIF4BP23588 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EIF4BP23588 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EIF4BP23588 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EIF4BP23588 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms