Protein–RNA interactions for Protein: P23415

GLRA1, Glycine receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLRA1P23415 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GLRA1P23415 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GLRA1P23415 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GLRA1P23415 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GLRA1P23415 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GLRA1P23415 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GLRA1P23415 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GLRA1P23415 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GLRA1P23415 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GLRA1P23415 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GLRA1P23415 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GLRA1P23415 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GLRA1P23415 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GLRA1P23415 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GLRA1P23415 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GLRA1P23415 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GLRA1P23415 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GLRA1P23415 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GLRA1P23415 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GLRA1P23415 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GLRA1P23415 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GLRA1P23415 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GLRA1P23415 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GLRA1P23415 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GLRA1P23415 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GLRA1P23415 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GLRA1P23415 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GLRA1P23415 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GLRA1P23415 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GLRA1P23415 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GLRA1P23415 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GLRA1P23415 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GLRA1P23415 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GLRA1P23415 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GLRA1P23415 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GLRA1P23415 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GLRA1P23415 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GLRA1P23415 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GLRA1P23415 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GLRA1P23415 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GLRA1P23415 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GLRA1P23415 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GLRA1P23415 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GLRA1P23415 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GLRA1P23415 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GLRA1P23415 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GLRA1P23415 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GLRA1P23415 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GLRA1P23415 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GLRA1P23415 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GLRA1P23415 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GLRA1P23415 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GLRA1P23415 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GLRA1P23415 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GLRA1P23415 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GLRA1P23415 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GLRA1P23415 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GLRA1P23415 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GLRA1P23415 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GLRA1P23415 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GLRA1P23415 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GLRA1P23415 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GLRA1P23415 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GLRA1P23415 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GLRA1P23415 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GLRA1P23415 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GLRA1P23415 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GLRA1P23415 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GLRA1P23415 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GLRA1P23415 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GLRA1P23415 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GLRA1P23415 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GLRA1P23415 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GLRA1P23415 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GLRA1P23415 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GLRA1P23415 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GLRA1P23415 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GLRA1P23415 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GLRA1P23415 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GLRA1P23415 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GLRA1P23415 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GLRA1P23415 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GLRA1P23415 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GLRA1P23415 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GLRA1P23415 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GLRA1P23415 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GLRA1P23415 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GLRA1P23415 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GLRA1P23415 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
GLRA1P23415 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GLRA1P23415 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GLRA1P23415 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GLRA1P23415 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GLRA1P23415 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GLRA1P23415 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GLRA1P23415 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GLRA1P23415 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GLRA1P23415 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GLRA1P23415 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GLRA1P23415 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms