Protein–RNA interactions for Protein: P22492

HIST1H1T, Histone H1t, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST1H1TP22492 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIST1H1TP22492 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIST1H1TP22492 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIST1H1TP22492 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIST1H1TP22492 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIST1H1TP22492 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIST1H1TP22492 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIST1H1TP22492 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIST1H1TP22492 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIST1H1TP22492 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIST1H1TP22492 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIST1H1TP22492 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIST1H1TP22492 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIST1H1TP22492 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIST1H1TP22492 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIST1H1TP22492 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIST1H1TP22492 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIST1H1TP22492 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIST1H1TP22492 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIST1H1TP22492 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIST1H1TP22492 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIST1H1TP22492 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIST1H1TP22492 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIST1H1TP22492 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIST1H1TP22492 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HIST1H1TP22492 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIST1H1TP22492 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIST1H1TP22492 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIST1H1TP22492 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIST1H1TP22492 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HIST1H1TP22492 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIST1H1TP22492 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIST1H1TP22492 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIST1H1TP22492 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIST1H1TP22492 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIST1H1TP22492 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIST1H1TP22492 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIST1H1TP22492 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HIST1H1TP22492 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIST1H1TP22492 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIST1H1TP22492 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIST1H1TP22492 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HIST1H1TP22492 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HIST1H1TP22492 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIST1H1TP22492 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIST1H1TP22492 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIST1H1TP22492 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIST1H1TP22492 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIST1H1TP22492 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIST1H1TP22492 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIST1H1TP22492 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIST1H1TP22492 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIST1H1TP22492 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIST1H1TP22492 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIST1H1TP22492 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIST1H1TP22492 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIST1H1TP22492 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIST1H1TP22492 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIST1H1TP22492 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIST1H1TP22492 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIST1H1TP22492 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HIST1H1TP22492 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIST1H1TP22492 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIST1H1TP22492 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIST1H1TP22492 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIST1H1TP22492 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIST1H1TP22492 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIST1H1TP22492 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIST1H1TP22492 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIST1H1TP22492 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIST1H1TP22492 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIST1H1TP22492 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIST1H1TP22492 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HIST1H1TP22492 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HIST1H1TP22492 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIST1H1TP22492 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIST1H1TP22492 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIST1H1TP22492 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIST1H1TP22492 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIST1H1TP22492 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIST1H1TP22492 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIST1H1TP22492 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIST1H1TP22492 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIST1H1TP22492 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIST1H1TP22492 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIST1H1TP22492 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIST1H1TP22492 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIST1H1TP22492 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIST1H1TP22492 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIST1H1TP22492 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIST1H1TP22492 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIST1H1TP22492 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIST1H1TP22492 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIST1H1TP22492 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HIST1H1TP22492 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIST1H1TP22492 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIST1H1TP22492 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIST1H1TP22492 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIST1H1TP22492 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIST1H1TP22492 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms