Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDK11BP21127 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDK11BP21127 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CDK11BP21127 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CDK11BP21127 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CDK11BP21127 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDK11BP21127 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CDK11BP21127 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDK11BP21127 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CDK11BP21127 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CDK11BP21127 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CDK11BP21127 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDK11BP21127 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CDK11BP21127 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CDK11BP21127 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDK11BP21127 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDK11BP21127 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CDK11BP21127 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CDK11BP21127 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CDK11BP21127 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CDK11BP21127 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CDK11BP21127 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDK11BP21127 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CDK11BP21127 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CDK11BP21127 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CDK11BP21127 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDK11BP21127 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDK11BP21127 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CDK11BP21127 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CDK11BP21127 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDK11BP21127 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDK11BP21127 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
CDK11BP21127 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDK11BP21127 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDK11BP21127 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CDK11BP21127 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
CDK11BP21127 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.51■■■□□ 2
CDK11BP21127 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CDK11BP21127 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDK11BP21127 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDK11BP21127 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK11BP21127 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK11BP21127 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK11BP21127 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK11BP21127 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK11BP21127 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK11BP21127 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK11BP21127 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK11BP21127 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK11BP21127 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK11BP21127 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK11BP21127 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDK11BP21127 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDK11BP21127 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDK11BP21127 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDK11BP21127 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDK11BP21127 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDK11BP21127 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDK11BP21127 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CDK11BP21127 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDK11BP21127 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDK11BP21127 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDK11BP21127 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDK11BP21127 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDK11BP21127 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDK11BP21127 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CDK11BP21127 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CDK11BP21127 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CDK11BP21127 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDK11BP21127 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDK11BP21127 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDK11BP21127 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDK11BP21127 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDK11BP21127 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDK11BP21127 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDK11BP21127 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDK11BP21127 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDK11BP21127 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDK11BP21127 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK11BP21127 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK11BP21127 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK11BP21127 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK11BP21127 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK11BP21127 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK11BP21127 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK11BP21127 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK11BP21127 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK11BP21127 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK11BP21127 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK11BP21127 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK11BP21127 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK11BP21127 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK11BP21127 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDK11BP21127 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDK11BP21127 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CDK11BP21127 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDK11BP21127 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CDK11BP21127 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDK11BP21127 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDK11BP21127 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms