Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP2B1P20020 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP2B1P20020 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP2B1P20020 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP2B1P20020 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP2B1P20020 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP2B1P20020 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP2B1P20020 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP2B1P20020 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP2B1P20020 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP2B1P20020 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP2B1P20020 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP2B1P20020 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP2B1P20020 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP2B1P20020 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP2B1P20020 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP2B1P20020 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP2B1P20020 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP2B1P20020 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP2B1P20020 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP2B1P20020 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP2B1P20020 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP2B1P20020 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP2B1P20020 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP2B1P20020 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP2B1P20020 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP2B1P20020 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP2B1P20020 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP2B1P20020 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP2B1P20020 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP2B1P20020 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP2B1P20020 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP2B1P20020 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP2B1P20020 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP2B1P20020 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP2B1P20020 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP2B1P20020 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP2B1P20020 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP2B1P20020 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP2B1P20020 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP2B1P20020 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP2B1P20020 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP2B1P20020 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP2B1P20020 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP2B1P20020 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP2B1P20020 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP2B1P20020 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP2B1P20020 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP2B1P20020 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP2B1P20020 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP2B1P20020 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP2B1P20020 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP2B1P20020 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP2B1P20020 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP2B1P20020 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
ATP2B1P20020 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
ATP2B1P20020 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP2B1P20020 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP2B1P20020 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP2B1P20020 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP2B1P20020 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP2B1P20020 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP2B1P20020 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP2B1P20020 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP2B1P20020 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP2B1P20020 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP2B1P20020 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP2B1P20020 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP2B1P20020 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP2B1P20020 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP2B1P20020 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP2B1P20020 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP2B1P20020 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP2B1P20020 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP2B1P20020 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP2B1P20020 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP2B1P20020 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP2B1P20020 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP2B1P20020 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP2B1P20020 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP2B1P20020 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP2B1P20020 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP2B1P20020 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ATP2B1P20020 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATP2B1P20020 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATP2B1P20020 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATP2B1P20020 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP2B1P20020 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP2B1P20020 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP2B1P20020 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP2B1P20020 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP2B1P20020 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP2B1P20020 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP2B1P20020 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP2B1P20020 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP2B1P20020 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP2B1P20020 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP2B1P20020 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP2B1P20020 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP2B1P20020 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms