Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFKB1P19838 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFKB1P19838 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFKB1P19838 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFKB1P19838 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFKB1P19838 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFKB1P19838 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NFKB1P19838 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFKB1P19838 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFKB1P19838 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFKB1P19838 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFKB1P19838 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFKB1P19838 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFKB1P19838 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFKB1P19838 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFKB1P19838 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFKB1P19838 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFKB1P19838 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFKB1P19838 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFKB1P19838 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NFKB1P19838 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFKB1P19838 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFKB1P19838 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFKB1P19838 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFKB1P19838 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFKB1P19838 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFKB1P19838 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFKB1P19838 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFKB1P19838 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFKB1P19838 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFKB1P19838 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFKB1P19838 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFKB1P19838 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFKB1P19838 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFKB1P19838 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFKB1P19838 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFKB1P19838 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFKB1P19838 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFKB1P19838 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFKB1P19838 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFKB1P19838 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFKB1P19838 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFKB1P19838 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFKB1P19838 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NFKB1P19838 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
NFKB1P19838 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NFKB1P19838 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFKB1P19838 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFKB1P19838 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFKB1P19838 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFKB1P19838 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFKB1P19838 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFKB1P19838 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFKB1P19838 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFKB1P19838 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFKB1P19838 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFKB1P19838 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFKB1P19838 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFKB1P19838 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFKB1P19838 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFKB1P19838 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFKB1P19838 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFKB1P19838 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFKB1P19838 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFKB1P19838 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFKB1P19838 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFKB1P19838 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFKB1P19838 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFKB1P19838 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFKB1P19838 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFKB1P19838 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFKB1P19838 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NFKB1P19838 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFKB1P19838 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFKB1P19838 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NFKB1P19838 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NFKB1P19838 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFKB1P19838 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFKB1P19838 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NFKB1P19838 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFKB1P19838 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFKB1P19838 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFKB1P19838 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFKB1P19838 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFKB1P19838 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFKB1P19838 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFKB1P19838 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFKB1P19838 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFKB1P19838 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFKB1P19838 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFKB1P19838 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFKB1P19838 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFKB1P19838 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFKB1P19838 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFKB1P19838 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFKB1P19838 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFKB1P19838 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFKB1P19838 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFKB1P19838 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFKB1P19838 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms