Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PGAM1P18669 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PGAM1P18669 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PGAM1P18669 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PGAM1P18669 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PGAM1P18669 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PGAM1P18669 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PGAM1P18669 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PGAM1P18669 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PGAM1P18669 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PGAM1P18669 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PGAM1P18669 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PGAM1P18669 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PGAM1P18669 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PGAM1P18669 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PGAM1P18669 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PGAM1P18669 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PGAM1P18669 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PGAM1P18669 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PGAM1P18669 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PGAM1P18669 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PGAM1P18669 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PGAM1P18669 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PGAM1P18669 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PGAM1P18669 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PGAM1P18669 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PGAM1P18669 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PGAM1P18669 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PGAM1P18669 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PGAM1P18669 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PGAM1P18669 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PGAM1P18669 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PGAM1P18669 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PGAM1P18669 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PGAM1P18669 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PGAM1P18669 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PGAM1P18669 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PGAM1P18669 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PGAM1P18669 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PGAM1P18669 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PGAM1P18669 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGAM1P18669 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGAM1P18669 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PGAM1P18669 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PGAM1P18669 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PGAM1P18669 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PGAM1P18669 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGAM1P18669 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGAM1P18669 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGAM1P18669 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGAM1P18669 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGAM1P18669 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PGAM1P18669 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PGAM1P18669 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PGAM1P18669 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PGAM1P18669 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PGAM1P18669 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PGAM1P18669 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PGAM1P18669 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PGAM1P18669 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGAM1P18669 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGAM1P18669 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGAM1P18669 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGAM1P18669 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGAM1P18669 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGAM1P18669 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGAM1P18669 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGAM1P18669 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGAM1P18669 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGAM1P18669 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGAM1P18669 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGAM1P18669 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGAM1P18669 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGAM1P18669 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGAM1P18669 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGAM1P18669 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGAM1P18669 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PGAM1P18669 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PGAM1P18669 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PGAM1P18669 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PGAM1P18669 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PGAM1P18669 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PGAM1P18669 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PGAM1P18669 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGAM1P18669 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGAM1P18669 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGAM1P18669 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGAM1P18669 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PGAM1P18669 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PGAM1P18669 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PGAM1P18669 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PGAM1P18669 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PGAM1P18669 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PGAM1P18669 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PGAM1P18669 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PGAM1P18669 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PGAM1P18669 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PGAM1P18669 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PGAM1P18669 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PGAM1P18669 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms