Protein–RNA interactions for Protein: P18428

LBP, Lipopolysaccharide-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBPP18428 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LBPP18428 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LBPP18428 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LBPP18428 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LBPP18428 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LBPP18428 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LBPP18428 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LBPP18428 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LBPP18428 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LBPP18428 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LBPP18428 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LBPP18428 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LBPP18428 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LBPP18428 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LBPP18428 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LBPP18428 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LBPP18428 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LBPP18428 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LBPP18428 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LBPP18428 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LBPP18428 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LBPP18428 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LBPP18428 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LBPP18428 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LBPP18428 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LBPP18428 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LBPP18428 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LBPP18428 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LBPP18428 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LBPP18428 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LBPP18428 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LBPP18428 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LBPP18428 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LBPP18428 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LBPP18428 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LBPP18428 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LBPP18428 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LBPP18428 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LBPP18428 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LBPP18428 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LBPP18428 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LBPP18428 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LBPP18428 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LBPP18428 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LBPP18428 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LBPP18428 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LBPP18428 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LBPP18428 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LBPP18428 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LBPP18428 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LBPP18428 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LBPP18428 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LBPP18428 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LBPP18428 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LBPP18428 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LBPP18428 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LBPP18428 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LBPP18428 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LBPP18428 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LBPP18428 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LBPP18428 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LBPP18428 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LBPP18428 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LBPP18428 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LBPP18428 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LBPP18428 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LBPP18428 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LBPP18428 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LBPP18428 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LBPP18428 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LBPP18428 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LBPP18428 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LBPP18428 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LBPP18428 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LBPP18428 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LBPP18428 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LBPP18428 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LBPP18428 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LBPP18428 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LBPP18428 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LBPP18428 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LBPP18428 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LBPP18428 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LBPP18428 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LBPP18428 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LBPP18428 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LBPP18428 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LBPP18428 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LBPP18428 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LBPP18428 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LBPP18428 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LBPP18428 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LBPP18428 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LBPP18428 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LBPP18428 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LBPP18428 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LBPP18428 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LBPP18428 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LBPP18428 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LBPP18428 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms