Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VCLP18206 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VCLP18206 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VCLP18206 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VCLP18206 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VCLP18206 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VCLP18206 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VCLP18206 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VCLP18206 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VCLP18206 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VCLP18206 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VCLP18206 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VCLP18206 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VCLP18206 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VCLP18206 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VCLP18206 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VCLP18206 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VCLP18206 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VCLP18206 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VCLP18206 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VCLP18206 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VCLP18206 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VCLP18206 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
VCLP18206 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VCLP18206 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
VCLP18206 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VCLP18206 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VCLP18206 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VCLP18206 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VCLP18206 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VCLP18206 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VCLP18206 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VCLP18206 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VCLP18206 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VCLP18206 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VCLP18206 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
VCLP18206 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VCLP18206 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VCLP18206 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VCLP18206 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VCLP18206 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VCLP18206 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VCLP18206 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VCLP18206 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VCLP18206 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VCLP18206 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
VCLP18206 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VCLP18206 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VCLP18206 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VCLP18206 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VCLP18206 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VCLP18206 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VCLP18206 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VCLP18206 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VCLP18206 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VCLP18206 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VCLP18206 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VCLP18206 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VCLP18206 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VCLP18206 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VCLP18206 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VCLP18206 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VCLP18206 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VCLP18206 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VCLP18206 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VCLP18206 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VCLP18206 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VCLP18206 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VCLP18206 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VCLP18206 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VCLP18206 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VCLP18206 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VCLP18206 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VCLP18206 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VCLP18206 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VCLP18206 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VCLP18206 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
VCLP18206 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
VCLP18206 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VCLP18206 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VCLP18206 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VCLP18206 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VCLP18206 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VCLP18206 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VCLP18206 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VCLP18206 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VCLP18206 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VCLP18206 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VCLP18206 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VCLP18206 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VCLP18206 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VCLP18206 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VCLP18206 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VCLP18206 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VCLP18206 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VCLP18206 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VCLP18206 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VCLP18206 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VCLP18206 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VCLP18206 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms