Protein–RNA interactions for Protein: P17677

GAP43, Neuromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAP43P17677 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GAP43P17677 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GAP43P17677 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GAP43P17677 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GAP43P17677 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GAP43P17677 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GAP43P17677 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GAP43P17677 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GAP43P17677 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GAP43P17677 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
GAP43P17677 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GAP43P17677 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GAP43P17677 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GAP43P17677 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GAP43P17677 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GAP43P17677 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GAP43P17677 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GAP43P17677 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GAP43P17677 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GAP43P17677 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GAP43P17677 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GAP43P17677 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
GAP43P17677 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GAP43P17677 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GAP43P17677 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GAP43P17677 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
GAP43P17677 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GAP43P17677 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GAP43P17677 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GAP43P17677 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GAP43P17677 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GAP43P17677 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GAP43P17677 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GAP43P17677 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GAP43P17677 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GAP43P17677 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GAP43P17677 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GAP43P17677 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GAP43P17677 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
GAP43P17677 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
GAP43P17677 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GAP43P17677 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GAP43P17677 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GAP43P17677 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GAP43P17677 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GAP43P17677 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GAP43P17677 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GAP43P17677 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GAP43P17677 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GAP43P17677 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GAP43P17677 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GAP43P17677 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GAP43P17677 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GAP43P17677 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GAP43P17677 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GAP43P17677 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GAP43P17677 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GAP43P17677 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GAP43P17677 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GAP43P17677 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GAP43P17677 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GAP43P17677 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GAP43P17677 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GAP43P17677 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GAP43P17677 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GAP43P17677 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GAP43P17677 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GAP43P17677 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GAP43P17677 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GAP43P17677 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GAP43P17677 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GAP43P17677 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GAP43P17677 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GAP43P17677 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GAP43P17677 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GAP43P17677 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
GAP43P17677 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GAP43P17677 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GAP43P17677 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GAP43P17677 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GAP43P17677 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GAP43P17677 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GAP43P17677 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GAP43P17677 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GAP43P17677 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GAP43P17677 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GAP43P17677 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GAP43P17677 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GAP43P17677 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GAP43P17677 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GAP43P17677 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GAP43P17677 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GAP43P17677 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GAP43P17677 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GAP43P17677 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GAP43P17677 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GAP43P17677 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GAP43P17677 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GAP43P17677 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GAP43P17677 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms