Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYN1P17600 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYN1P17600 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYN1P17600 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYN1P17600 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYN1P17600 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYN1P17600 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYN1P17600 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYN1P17600 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SYN1P17600 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYN1P17600 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYN1P17600 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYN1P17600 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYN1P17600 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYN1P17600 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYN1P17600 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYN1P17600 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYN1P17600 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYN1P17600 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYN1P17600 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYN1P17600 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SYN1P17600 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SYN1P17600 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SYN1P17600 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
SYN1P17600 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SYN1P17600 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
SYN1P17600 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYN1P17600 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYN1P17600 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
SYN1P17600 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SYN1P17600 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SYN1P17600 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYN1P17600 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SYN1P17600 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SYN1P17600 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SYN1P17600 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYN1P17600 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SYN1P17600 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYN1P17600 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SYN1P17600 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SYN1P17600 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SYN1P17600 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SYN1P17600 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SYN1P17600 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYN1P17600 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SYN1P17600 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SYN1P17600 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYN1P17600 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYN1P17600 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYN1P17600 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYN1P17600 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SYN1P17600 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYN1P17600 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYN1P17600 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYN1P17600 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYN1P17600 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYN1P17600 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYN1P17600 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYN1P17600 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYN1P17600 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYN1P17600 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYN1P17600 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SYN1P17600 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SYN1P17600 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SYN1P17600 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SYN1P17600 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYN1P17600 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYN1P17600 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYN1P17600 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYN1P17600 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYN1P17600 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SYN1P17600 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYN1P17600 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYN1P17600 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYN1P17600 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYN1P17600 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYN1P17600 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYN1P17600 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYN1P17600 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYN1P17600 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYN1P17600 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYN1P17600 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYN1P17600 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYN1P17600 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYN1P17600 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYN1P17600 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYN1P17600 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYN1P17600 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYN1P17600 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYN1P17600 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYN1P17600 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYN1P17600 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYN1P17600 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYN1P17600 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYN1P17600 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYN1P17600 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYN1P17600 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYN1P17600 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYN1P17600 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SYN1P17600 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms