Protein–RNA interactions for Protein: P17480

UBTF, Nucleolar transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFP17480 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
UBTFP17480 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
UBTFP17480 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
UBTFP17480 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
UBTFP17480 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.05
UBTFP17480 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
UBTFP17480 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
UBTFP17480 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
UBTFP17480 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
UBTFP17480 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC40.28■■■■■ 4.04
UBTFP17480 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
UBTFP17480 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.04
UBTFP17480 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.04
UBTFP17480 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
UBTFP17480 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
UBTFP17480 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.04
UBTFP17480 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
UBTFP17480 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
UBTFP17480 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
UBTFP17480 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
UBTFP17480 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
UBTFP17480 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
UBTFP17480 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
UBTFP17480 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
UBTFP17480 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC40.23■■■■■ 4.03
UBTFP17480 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
UBTFP17480 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
UBTFP17480 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
UBTFP17480 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
UBTFP17480 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
UBTFP17480 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC40.22■■■■■ 4.03
UBTFP17480 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC40.22■■■■■ 4.03
UBTFP17480 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
UBTFP17480 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
UBTFP17480 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC40.21■■■■■ 4.03
UBTFP17480 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC40.21■■■■■ 4.03
UBTFP17480 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
UBTFP17480 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
UBTFP17480 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
UBTFP17480 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
UBTFP17480 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
UBTFP17480 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
UBTFP17480 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
UBTFP17480 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
UBTFP17480 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
UBTFP17480 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
UBTFP17480 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
UBTFP17480 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC40.18■■■■■ 4.02
UBTFP17480 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.18■■■■■ 4.02
UBTFP17480 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.17■■■■■ 4.02
UBTFP17480 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
UBTFP17480 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
UBTFP17480 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
UBTFP17480 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
UBTFP17480 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
UBTFP17480 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
UBTFP17480 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
UBTFP17480 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
UBTFP17480 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
UBTFP17480 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
UBTFP17480 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC40.16■■■■■ 4.02
UBTFP17480 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
UBTFP17480 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
UBTFP17480 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
UBTFP17480 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
UBTFP17480 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
UBTFP17480 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
UBTFP17480 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.02
UBTFP17480 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
UBTFP17480 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
UBTFP17480 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC40.13■■■■■ 4.01
UBTFP17480 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC40.13■■■■■ 4.01
UBTFP17480 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
UBTFP17480 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
UBTFP17480 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
UBTFP17480 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
UBTFP17480 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
UBTFP17480 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC40.11■■■■■ 4.01
UBTFP17480 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
UBTFP17480 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
UBTFP17480 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
UBTFP17480 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
UBTFP17480 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
UBTFP17480 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC40.08■■■■■ 4.01
UBTFP17480 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC40.08■■■■■ 4.01
UBTFP17480 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4.01
UBTFP17480 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
UBTFP17480 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC40.07■■■■■ 4.01
UBTFP17480 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4.01
UBTFP17480 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC40.07■■■■■ 4
UBTFP17480 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
UBTFP17480 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
UBTFP17480 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
UBTFP17480 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC40.06■■■■■ 4
UBTFP17480 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
UBTFP17480 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
UBTFP17480 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
UBTFP17480 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
UBTFP17480 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
UBTFP17480 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms