Protein–RNA interactions for Protein: P17252

PRKCA, Protein kinase C alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCAP17252 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCAP17252 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKCAP17252 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCAP17252 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCAP17252 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCAP17252 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCAP17252 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCAP17252 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCAP17252 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCAP17252 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCAP17252 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKCAP17252 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKCAP17252 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKCAP17252 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKCAP17252 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKCAP17252 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKCAP17252 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCAP17252 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCAP17252 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCAP17252 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCAP17252 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKCAP17252 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKCAP17252 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKCAP17252 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKCAP17252 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKCAP17252 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKCAP17252 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKCAP17252 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKCAP17252 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKCAP17252 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKCAP17252 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKCAP17252 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRKCAP17252 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRKCAP17252 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRKCAP17252 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRKCAP17252 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKCAP17252 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKCAP17252 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKCAP17252 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKCAP17252 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCAP17252 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCAP17252 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCAP17252 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCAP17252 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCAP17252 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCAP17252 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCAP17252 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCAP17252 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCAP17252 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCAP17252 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCAP17252 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCAP17252 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCAP17252 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCAP17252 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCAP17252 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCAP17252 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCAP17252 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCAP17252 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCAP17252 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCAP17252 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCAP17252 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCAP17252 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCAP17252 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKCAP17252 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKCAP17252 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKCAP17252 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKCAP17252 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKCAP17252 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKCAP17252 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKCAP17252 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKCAP17252 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKCAP17252 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKCAP17252 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKCAP17252 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKCAP17252 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKCAP17252 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKCAP17252 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKCAP17252 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKCAP17252 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKCAP17252 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRKCAP17252 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRKCAP17252 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKCAP17252 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKCAP17252 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKCAP17252 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKCAP17252 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKCAP17252 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKCAP17252 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKCAP17252 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKCAP17252 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKCAP17252 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKCAP17252 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKCAP17252 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKCAP17252 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKCAP17252 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKCAP17252 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKCAP17252 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKCAP17252 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKCAP17252 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKCAP17252 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms