Protein–RNA interactions for Protein: P15882

CHN1, N-chimaerin, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHN1P15882 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHN1P15882 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHN1P15882 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHN1P15882 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHN1P15882 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHN1P15882 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHN1P15882 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHN1P15882 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHN1P15882 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHN1P15882 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHN1P15882 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHN1P15882 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHN1P15882 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHN1P15882 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHN1P15882 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHN1P15882 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHN1P15882 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHN1P15882 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHN1P15882 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHN1P15882 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHN1P15882 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHN1P15882 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHN1P15882 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHN1P15882 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHN1P15882 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHN1P15882 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHN1P15882 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHN1P15882 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHN1P15882 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHN1P15882 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHN1P15882 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHN1P15882 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHN1P15882 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHN1P15882 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHN1P15882 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CHN1P15882 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CHN1P15882 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHN1P15882 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHN1P15882 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHN1P15882 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHN1P15882 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHN1P15882 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHN1P15882 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHN1P15882 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHN1P15882 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHN1P15882 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CHN1P15882 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHN1P15882 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHN1P15882 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHN1P15882 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHN1P15882 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHN1P15882 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHN1P15882 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CHN1P15882 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHN1P15882 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHN1P15882 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CHN1P15882 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHN1P15882 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHN1P15882 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHN1P15882 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHN1P15882 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHN1P15882 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHN1P15882 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHN1P15882 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHN1P15882 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHN1P15882 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHN1P15882 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHN1P15882 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHN1P15882 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHN1P15882 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHN1P15882 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHN1P15882 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHN1P15882 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHN1P15882 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHN1P15882 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHN1P15882 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHN1P15882 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHN1P15882 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHN1P15882 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHN1P15882 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CHN1P15882 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHN1P15882 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHN1P15882 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHN1P15882 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHN1P15882 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHN1P15882 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHN1P15882 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHN1P15882 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHN1P15882 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHN1P15882 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CHN1P15882 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHN1P15882 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHN1P15882 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHN1P15882 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHN1P15882 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHN1P15882 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHN1P15882 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHN1P15882 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHN1P15882 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHN1P15882 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms