Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRAFP15056 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRAFP15056 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRAFP15056 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRAFP15056 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRAFP15056 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BRAFP15056 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRAFP15056 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRAFP15056 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRAFP15056 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRAFP15056 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRAFP15056 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BRAFP15056 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
BRAFP15056 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRAFP15056 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRAFP15056 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRAFP15056 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
BRAFP15056 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
BRAFP15056 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
BRAFP15056 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
BRAFP15056 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
BRAFP15056 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
BRAFP15056 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
BRAFP15056 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
BRAFP15056 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
BRAFP15056 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRAFP15056 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
BRAFP15056 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRAFP15056 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BRAFP15056 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
BRAFP15056 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRAFP15056 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRAFP15056 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRAFP15056 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRAFP15056 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRAFP15056 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRAFP15056 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRAFP15056 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRAFP15056 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRAFP15056 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRAFP15056 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRAFP15056 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRAFP15056 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRAFP15056 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRAFP15056 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRAFP15056 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRAFP15056 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRAFP15056 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRAFP15056 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRAFP15056 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRAFP15056 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRAFP15056 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRAFP15056 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRAFP15056 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRAFP15056 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRAFP15056 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRAFP15056 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRAFP15056 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRAFP15056 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRAFP15056 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRAFP15056 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRAFP15056 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRAFP15056 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRAFP15056 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRAFP15056 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRAFP15056 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRAFP15056 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRAFP15056 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRAFP15056 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRAFP15056 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRAFP15056 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRAFP15056 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRAFP15056 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRAFP15056 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRAFP15056 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BRAFP15056 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRAFP15056 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRAFP15056 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRAFP15056 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
BRAFP15056 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRAFP15056 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRAFP15056 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRAFP15056 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRAFP15056 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRAFP15056 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRAFP15056 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRAFP15056 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRAFP15056 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRAFP15056 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRAFP15056 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
BRAFP15056 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRAFP15056 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRAFP15056 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRAFP15056 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRAFP15056 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRAFP15056 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRAFP15056 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRAFP15056 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
BRAFP15056 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRAFP15056 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms