Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRA1P14867 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRA1P14867 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRA1P14867 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRA1P14867 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRA1P14867 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRA1P14867 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRA1P14867 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRA1P14867 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRA1P14867 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GABRA1P14867 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GABRA1P14867 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GABRA1P14867 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRA1P14867 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRA1P14867 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRA1P14867 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRA1P14867 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRA1P14867 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRA1P14867 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRA1P14867 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRA1P14867 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRA1P14867 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRA1P14867 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRA1P14867 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRA1P14867 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRA1P14867 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRA1P14867 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRA1P14867 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRA1P14867 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRA1P14867 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRA1P14867 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRA1P14867 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRA1P14867 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRA1P14867 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRA1P14867 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRA1P14867 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRA1P14867 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRA1P14867 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRA1P14867 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRA1P14867 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRA1P14867 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRA1P14867 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRA1P14867 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRA1P14867 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRA1P14867 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRA1P14867 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRA1P14867 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRA1P14867 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRA1P14867 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRA1P14867 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABRA1P14867 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GABRA1P14867 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GABRA1P14867 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRA1P14867 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRA1P14867 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRA1P14867 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRA1P14867 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRA1P14867 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRA1P14867 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRA1P14867 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRA1P14867 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRA1P14867 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRA1P14867 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRA1P14867 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRA1P14867 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRA1P14867 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRA1P14867 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRA1P14867 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRA1P14867 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRA1P14867 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRA1P14867 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRA1P14867 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRA1P14867 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRA1P14867 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRA1P14867 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRA1P14867 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRA1P14867 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRA1P14867 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRA1P14867 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRA1P14867 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRA1P14867 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRA1P14867 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRA1P14867 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRA1P14867 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRA1P14867 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRA1P14867 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRA1P14867 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRA1P14867 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRA1P14867 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRA1P14867 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRA1P14867 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRA1P14867 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRA1P14867 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRA1P14867 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRA1P14867 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRA1P14867 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRA1P14867 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRA1P14867 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRA1P14867 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRA1P14867 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms