Protein–RNA interactions for Protein: P14136

GFAP, Glial fibrillary acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFAPP14136 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GFAPP14136 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GFAPP14136 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GFAPP14136 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GFAPP14136 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GFAPP14136 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GFAPP14136 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GFAPP14136 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GFAPP14136 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GFAPP14136 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GFAPP14136 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GFAPP14136 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GFAPP14136 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GFAPP14136 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GFAPP14136 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GFAPP14136 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GFAPP14136 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GFAPP14136 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GFAPP14136 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GFAPP14136 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GFAPP14136 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GFAPP14136 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GFAPP14136 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GFAPP14136 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GFAPP14136 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GFAPP14136 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GFAPP14136 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GFAPP14136 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GFAPP14136 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GFAPP14136 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GFAPP14136 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GFAPP14136 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GFAPP14136 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GFAPP14136 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GFAPP14136 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GFAPP14136 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GFAPP14136 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GFAPP14136 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GFAPP14136 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GFAPP14136 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GFAPP14136 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GFAPP14136 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GFAPP14136 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GFAPP14136 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GFAPP14136 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GFAPP14136 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GFAPP14136 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GFAPP14136 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GFAPP14136 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GFAPP14136 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GFAPP14136 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GFAPP14136 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GFAPP14136 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GFAPP14136 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GFAPP14136 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GFAPP14136 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GFAPP14136 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GFAPP14136 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GFAPP14136 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GFAPP14136 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GFAPP14136 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GFAPP14136 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GFAPP14136 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GFAPP14136 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GFAPP14136 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GFAPP14136 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GFAPP14136 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GFAPP14136 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GFAPP14136 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GFAPP14136 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GFAPP14136 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GFAPP14136 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GFAPP14136 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GFAPP14136 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GFAPP14136 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GFAPP14136 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GFAPP14136 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GFAPP14136 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GFAPP14136 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GFAPP14136 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GFAPP14136 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GFAPP14136 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GFAPP14136 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GFAPP14136 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GFAPP14136 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GFAPP14136 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GFAPP14136 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GFAPP14136 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GFAPP14136 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GFAPP14136 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GFAPP14136 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GFAPP14136 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GFAPP14136 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GFAPP14136 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GFAPP14136 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GFAPP14136 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GFAPP14136 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GFAPP14136 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GFAPP14136 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GFAPP14136 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms