Protein–RNA interactions for Protein: P13688

CEACAM1, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM1P13688 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEACAM1P13688 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEACAM1P13688 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEACAM1P13688 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEACAM1P13688 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEACAM1P13688 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEACAM1P13688 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEACAM1P13688 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEACAM1P13688 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEACAM1P13688 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEACAM1P13688 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEACAM1P13688 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CEACAM1P13688 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CEACAM1P13688 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CEACAM1P13688 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CEACAM1P13688 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEACAM1P13688 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEACAM1P13688 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEACAM1P13688 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEACAM1P13688 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEACAM1P13688 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEACAM1P13688 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEACAM1P13688 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEACAM1P13688 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEACAM1P13688 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEACAM1P13688 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEACAM1P13688 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEACAM1P13688 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CEACAM1P13688 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEACAM1P13688 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEACAM1P13688 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEACAM1P13688 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEACAM1P13688 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CEACAM1P13688 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CEACAM1P13688 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CEACAM1P13688 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CEACAM1P13688 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CEACAM1P13688 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CEACAM1P13688 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEACAM1P13688 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEACAM1P13688 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEACAM1P13688 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEACAM1P13688 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEACAM1P13688 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEACAM1P13688 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEACAM1P13688 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEACAM1P13688 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEACAM1P13688 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEACAM1P13688 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEACAM1P13688 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEACAM1P13688 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEACAM1P13688 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEACAM1P13688 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEACAM1P13688 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEACAM1P13688 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEACAM1P13688 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEACAM1P13688 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CEACAM1P13688 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CEACAM1P13688 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEACAM1P13688 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEACAM1P13688 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CEACAM1P13688 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEACAM1P13688 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEACAM1P13688 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEACAM1P13688 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEACAM1P13688 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEACAM1P13688 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEACAM1P13688 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEACAM1P13688 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEACAM1P13688 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEACAM1P13688 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEACAM1P13688 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEACAM1P13688 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEACAM1P13688 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEACAM1P13688 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEACAM1P13688 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEACAM1P13688 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEACAM1P13688 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEACAM1P13688 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEACAM1P13688 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEACAM1P13688 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEACAM1P13688 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEACAM1P13688 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEACAM1P13688 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CEACAM1P13688 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEACAM1P13688 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEACAM1P13688 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEACAM1P13688 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEACAM1P13688 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CEACAM1P13688 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CEACAM1P13688 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEACAM1P13688 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEACAM1P13688 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEACAM1P13688 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEACAM1P13688 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEACAM1P13688 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEACAM1P13688 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEACAM1P13688 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEACAM1P13688 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEACAM1P13688 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms