Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
CFTRP13569 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC43.64■■■■■ 4.58
CFTRP13569 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.64■■■■■ 4.58
CFTRP13569 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC43.64■■■■■ 4.58
CFTRP13569 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
CFTRP13569 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.57
CFTRP13569 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC43.63■■■■■ 4.57
CFTRP13569 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
CFTRP13569 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
CFTRP13569 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.61■■■■■ 4.57
CFTRP13569 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
CFTRP13569 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC43.6■■■■■ 4.57
CFTRP13569 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC43.6■■■■■ 4.57
CFTRP13569 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC43.6■■■■■ 4.57
CFTRP13569 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC43.6■■■■■ 4.57
CFTRP13569 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC43.59■■■■■ 4.57
CFTRP13569 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC43.59■■■■■ 4.57
CFTRP13569 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC43.59■■■■■ 4.57
CFTRP13569 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
CFTRP13569 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC43.58■■■■■ 4.57
CFTRP13569 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC43.58■■■■■ 4.57
CFTRP13569 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
CFTRP13569 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC43.57■■■■■ 4.57
CFTRP13569 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
CFTRP13569 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.56
CFTRP13569 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC43.57■■■■■ 4.56
CFTRP13569 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC43.56■■■■■ 4.56
CFTRP13569 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC43.55■■■■■ 4.56
CFTRP13569 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC43.55■■■■■ 4.56
CFTRP13569 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC43.55■■■■■ 4.56
CFTRP13569 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
CFTRP13569 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
CFTRP13569 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
CFTRP13569 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.52■■■■■ 4.56
CFTRP13569 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC43.52■■■■■ 4.56
CFTRP13569 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
CFTRP13569 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC43.51■■■■■ 4.56
CFTRP13569 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
CFTRP13569 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
CFTRP13569 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
CFTRP13569 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC43.51■■■■■ 4.56
CFTRP13569 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.51■■■■■ 4.55
CFTRP13569 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC43.5■■■■■ 4.55
CFTRP13569 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.49■■■■■ 4.55
CFTRP13569 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC43.49■■■■■ 4.55
CFTRP13569 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
CFTRP13569 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC43.48■■■■■ 4.55
CFTRP13569 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC43.48■■■■■ 4.55
CFTRP13569 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.48■■■■■ 4.55
CFTRP13569 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
CFTRP13569 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
CFTRP13569 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC43.47■■■■■ 4.55
CFTRP13569 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
CFTRP13569 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
CFTRP13569 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
CFTRP13569 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC43.45■■■■■ 4.55
CFTRP13569 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC43.45■■■■■ 4.55
CFTRP13569 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
CFTRP13569 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.45■■■■■ 4.55
CFTRP13569 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
CFTRP13569 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.55
CFTRP13569 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
CFTRP13569 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC43.44■■■■■ 4.54
CFTRP13569 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC43.43■■■■■ 4.54
CFTRP13569 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC43.43■■■■■ 4.54
CFTRP13569 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC43.42■■■■■ 4.54
CFTRP13569 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC43.42■■■■■ 4.54
CFTRP13569 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.42■■■■■ 4.54
CFTRP13569 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC43.41■■■■■ 4.54
CFTRP13569 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.4■■■■■ 4.54
CFTRP13569 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC43.4■■■■■ 4.54
CFTRP13569 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC43.39■■■■■ 4.54
CFTRP13569 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
CFTRP13569 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC43.38■■■■■ 4.54
CFTRP13569 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.54
CFTRP13569 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
CFTRP13569 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC43.37■■■■■ 4.53
CFTRP13569 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC43.37■■■■■ 4.53
CFTRP13569 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
CFTRP13569 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC43.35■■■■■ 4.53
CFTRP13569 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.34■■■■■ 4.53
CFTRP13569 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
CFTRP13569 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC43.32■■■■■ 4.53
CFTRP13569 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC43.32■■■■■ 4.53
CFTRP13569 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC43.32■■■■■ 4.53
CFTRP13569 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC43.32■■■■■ 4.53
CFTRP13569 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.32■■■■■ 4.52
CFTRP13569 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC43.32■■■■■ 4.52
CFTRP13569 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
CFTRP13569 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
CFTRP13569 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC43.31■■■■■ 4.52
CFTRP13569 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC43.31■■■■■ 4.52
CFTRP13569 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
CFTRP13569 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.29■■■■■ 4.52
CFTRP13569 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
CFTRP13569 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC43.28■■■■■ 4.52
CFTRP13569 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
CFTRP13569 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
CFTRP13569 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
CFTRP13569 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC43.27■■■■■ 4.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms