Protein–RNA interactions for Protein: P12755

SKI, Ski oncogene, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIP12755 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SKIP12755 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SKIP12755 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SKIP12755 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SKIP12755 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SKIP12755 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SKIP12755 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SKIP12755 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SKIP12755 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SKIP12755 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SKIP12755 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SKIP12755 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SKIP12755 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SKIP12755 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SKIP12755 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SKIP12755 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SKIP12755 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SKIP12755 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SKIP12755 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SKIP12755 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SKIP12755 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SKIP12755 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SKIP12755 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SKIP12755 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SKIP12755 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SKIP12755 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SKIP12755 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SKIP12755 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SKIP12755 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SKIP12755 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SKIP12755 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SKIP12755 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SKIP12755 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SKIP12755 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SKIP12755 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SKIP12755 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SKIP12755 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SKIP12755 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SKIP12755 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SKIP12755 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SKIP12755 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SKIP12755 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SKIP12755 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SKIP12755 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SKIP12755 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SKIP12755 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SKIP12755 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SKIP12755 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SKIP12755 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SKIP12755 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SKIP12755 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SKIP12755 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SKIP12755 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SKIP12755 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SKIP12755 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SKIP12755 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SKIP12755 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SKIP12755 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SKIP12755 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SKIP12755 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SKIP12755 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SKIP12755 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SKIP12755 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SKIP12755 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SKIP12755 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SKIP12755 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SKIP12755 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SKIP12755 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SKIP12755 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SKIP12755 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SKIP12755 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SKIP12755 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SKIP12755 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SKIP12755 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SKIP12755 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SKIP12755 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SKIP12755 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SKIP12755 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SKIP12755 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SKIP12755 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SKIP12755 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SKIP12755 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SKIP12755 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SKIP12755 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SKIP12755 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SKIP12755 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SKIP12755 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SKIP12755 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SKIP12755 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SKIP12755 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SKIP12755 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SKIP12755 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SKIP12755 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SKIP12755 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SKIP12755 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SKIP12755 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SKIP12755 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SKIP12755 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SKIP12755 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SKIP12755 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.5 ms