Protein–RNA interactions for Protein: P11487

FGF3, Fibroblast growth factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF3P11487 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGF3P11487 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGF3P11487 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGF3P11487 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
FGF3P11487 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGF3P11487 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGF3P11487 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGF3P11487 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGF3P11487 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FGF3P11487 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FGF3P11487 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FGF3P11487 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FGF3P11487 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FGF3P11487 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FGF3P11487 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGF3P11487 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGF3P11487 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGF3P11487 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGF3P11487 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGF3P11487 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGF3P11487 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FGF3P11487 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FGF3P11487 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FGF3P11487 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FGF3P11487 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FGF3P11487 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FGF3P11487 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FGF3P11487 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FGF3P11487 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FGF3P11487 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FGF3P11487 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FGF3P11487 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FGF3P11487 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGF3P11487 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGF3P11487 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGF3P11487 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGF3P11487 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGF3P11487 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGF3P11487 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGF3P11487 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGF3P11487 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGF3P11487 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FGF3P11487 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FGF3P11487 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FGF3P11487 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FGF3P11487 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGF3P11487 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGF3P11487 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGF3P11487 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGF3P11487 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGF3P11487 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FGF3P11487 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FGF3P11487 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FGF3P11487 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FGF3P11487 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FGF3P11487 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FGF3P11487 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGF3P11487 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGF3P11487 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGF3P11487 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGF3P11487 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGF3P11487 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGF3P11487 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGF3P11487 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FGF3P11487 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FGF3P11487 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FGF3P11487 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FGF3P11487 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FGF3P11487 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FGF3P11487 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FGF3P11487 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FGF3P11487 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FGF3P11487 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FGF3P11487 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FGF3P11487 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FGF3P11487 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FGF3P11487 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGF3P11487 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FGF3P11487 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGF3P11487 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGF3P11487 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGF3P11487 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGF3P11487 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGF3P11487 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGF3P11487 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGF3P11487 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FGF3P11487 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FGF3P11487 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FGF3P11487 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FGF3P11487 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FGF3P11487 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FGF3P11487 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FGF3P11487 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FGF3P11487 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FGF3P11487 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGF3P11487 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGF3P11487 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGF3P11487 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGF3P11487 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGF3P11487 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms