Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CD28P10747 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CD28P10747 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CD28P10747 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CD28P10747 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CD28P10747 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD28P10747 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD28P10747 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD28P10747 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD28P10747 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD28P10747 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CD28P10747 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD28P10747 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD28P10747 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD28P10747 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD28P10747 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD28P10747 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD28P10747 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD28P10747 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD28P10747 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CD28P10747 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CD28P10747 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CD28P10747 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CD28P10747 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CD28P10747 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CD28P10747 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CD28P10747 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CD28P10747 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CD28P10747 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CD28P10747 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD28P10747 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD28P10747 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CD28P10747 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD28P10747 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD28P10747 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD28P10747 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD28P10747 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD28P10747 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD28P10747 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD28P10747 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD28P10747 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD28P10747 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD28P10747 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD28P10747 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD28P10747 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD28P10747 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD28P10747 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD28P10747 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CD28P10747 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD28P10747 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD28P10747 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD28P10747 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD28P10747 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD28P10747 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD28P10747 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD28P10747 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD28P10747 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD28P10747 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD28P10747 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD28P10747 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD28P10747 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD28P10747 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CD28P10747 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CD28P10747 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CD28P10747 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD28P10747 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD28P10747 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD28P10747 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD28P10747 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD28P10747 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD28P10747 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD28P10747 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD28P10747 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD28P10747 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD28P10747 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD28P10747 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD28P10747 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD28P10747 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD28P10747 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD28P10747 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CD28P10747 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD28P10747 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CD28P10747 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD28P10747 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD28P10747 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD28P10747 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD28P10747 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD28P10747 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD28P10747 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD28P10747 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD28P10747 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD28P10747 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD28P10747 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD28P10747 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD28P10747 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD28P10747 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD28P10747 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD28P10747 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD28P10747 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD28P10747 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms