Protein–RNA interactions for Protein: P10606

COX5B, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5BP10606 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COX5BP10606 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COX5BP10606 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COX5BP10606 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COX5BP10606 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COX5BP10606 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COX5BP10606 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COX5BP10606 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COX5BP10606 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COX5BP10606 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COX5BP10606 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COX5BP10606 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COX5BP10606 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COX5BP10606 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COX5BP10606 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COX5BP10606 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COX5BP10606 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COX5BP10606 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COX5BP10606 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COX5BP10606 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COX5BP10606 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COX5BP10606 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COX5BP10606 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COX5BP10606 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COX5BP10606 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COX5BP10606 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COX5BP10606 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COX5BP10606 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COX5BP10606 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COX5BP10606 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
COX5BP10606 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COX5BP10606 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COX5BP10606 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
COX5BP10606 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COX5BP10606 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COX5BP10606 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COX5BP10606 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COX5BP10606 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COX5BP10606 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COX5BP10606 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COX5BP10606 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COX5BP10606 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COX5BP10606 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COX5BP10606 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COX5BP10606 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COX5BP10606 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
COX5BP10606 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COX5BP10606 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COX5BP10606 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COX5BP10606 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COX5BP10606 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
COX5BP10606 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COX5BP10606 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COX5BP10606 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COX5BP10606 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COX5BP10606 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COX5BP10606 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COX5BP10606 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COX5BP10606 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COX5BP10606 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COX5BP10606 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COX5BP10606 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COX5BP10606 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COX5BP10606 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COX5BP10606 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COX5BP10606 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COX5BP10606 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COX5BP10606 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COX5BP10606 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COX5BP10606 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COX5BP10606 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COX5BP10606 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COX5BP10606 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COX5BP10606 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COX5BP10606 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COX5BP10606 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COX5BP10606 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COX5BP10606 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COX5BP10606 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COX5BP10606 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COX5BP10606 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COX5BP10606 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COX5BP10606 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COX5BP10606 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COX5BP10606 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COX5BP10606 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COX5BP10606 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COX5BP10606 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COX5BP10606 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COX5BP10606 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COX5BP10606 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COX5BP10606 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COX5BP10606 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COX5BP10606 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COX5BP10606 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COX5BP10606 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COX5BP10606 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COX5BP10606 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COX5BP10606 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
COX5BP10606 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms