Protein–RNA interactions for Protein: P10092

CALCB, Calcitonin gene-related peptide 2, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCBP10092 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALCBP10092 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALCBP10092 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALCBP10092 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALCBP10092 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALCBP10092 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CALCBP10092 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALCBP10092 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALCBP10092 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALCBP10092 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALCBP10092 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALCBP10092 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALCBP10092 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CALCBP10092 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALCBP10092 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALCBP10092 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CALCBP10092 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALCBP10092 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALCBP10092 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALCBP10092 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALCBP10092 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALCBP10092 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALCBP10092 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALCBP10092 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALCBP10092 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALCBP10092 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALCBP10092 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALCBP10092 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALCBP10092 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALCBP10092 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALCBP10092 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALCBP10092 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALCBP10092 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALCBP10092 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALCBP10092 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALCBP10092 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALCBP10092 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALCBP10092 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALCBP10092 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALCBP10092 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALCBP10092 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALCBP10092 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALCBP10092 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALCBP10092 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALCBP10092 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALCBP10092 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALCBP10092 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALCBP10092 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALCBP10092 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALCBP10092 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALCBP10092 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALCBP10092 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALCBP10092 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALCBP10092 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALCBP10092 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALCBP10092 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALCBP10092 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALCBP10092 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CALCBP10092 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CALCBP10092 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALCBP10092 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALCBP10092 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALCBP10092 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALCBP10092 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALCBP10092 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALCBP10092 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALCBP10092 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALCBP10092 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALCBP10092 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALCBP10092 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALCBP10092 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALCBP10092 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALCBP10092 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALCBP10092 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CALCBP10092 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALCBP10092 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALCBP10092 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALCBP10092 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALCBP10092 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALCBP10092 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALCBP10092 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALCBP10092 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALCBP10092 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALCBP10092 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALCBP10092 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CALCBP10092 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALCBP10092 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALCBP10092 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALCBP10092 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALCBP10092 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CALCBP10092 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CALCBP10092 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CALCBP10092 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CALCBP10092 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CALCBP10092 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CALCBP10092 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CALCBP10092 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CALCBP10092 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CALCBP10092 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CALCBP10092 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms