Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
C8orf88P0DMB2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
C8orf88P0DMB2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
C8orf88P0DMB2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
C8orf88P0DMB2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
C8orf88P0DMB2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
C8orf88P0DMB2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
C8orf88P0DMB2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
C8orf88P0DMB2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
C8orf88P0DMB2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
C8orf88P0DMB2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
C8orf88P0DMB2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
C8orf88P0DMB2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
C8orf88P0DMB2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
C8orf88P0DMB2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
C8orf88P0DMB2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
C8orf88P0DMB2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
C8orf88P0DMB2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
C8orf88P0DMB2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
C8orf88P0DMB2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
C8orf88P0DMB2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C8orf88P0DMB2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C8orf88P0DMB2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C8orf88P0DMB2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
C8orf88P0DMB2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
C8orf88P0DMB2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C8orf88P0DMB2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
C8orf88P0DMB2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C8orf88P0DMB2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
C8orf88P0DMB2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C8orf88P0DMB2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C8orf88P0DMB2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
C8orf88P0DMB2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
C8orf88P0DMB2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
C8orf88P0DMB2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
C8orf88P0DMB2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
C8orf88P0DMB2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
C8orf88P0DMB2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
C8orf88P0DMB2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
C8orf88P0DMB2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
C8orf88P0DMB2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C8orf88P0DMB2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C8orf88P0DMB2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C8orf88P0DMB2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C8orf88P0DMB2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C8orf88P0DMB2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C8orf88P0DMB2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C8orf88P0DMB2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C8orf88P0DMB2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C8orf88P0DMB2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C8orf88P0DMB2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C8orf88P0DMB2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C8orf88P0DMB2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C8orf88P0DMB2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C8orf88P0DMB2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C8orf88P0DMB2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C8orf88P0DMB2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
C8orf88P0DMB2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C8orf88P0DMB2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C8orf88P0DMB2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C8orf88P0DMB2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C8orf88P0DMB2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C8orf88P0DMB2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C8orf88P0DMB2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C8orf88P0DMB2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C8orf88P0DMB2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C8orf88P0DMB2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C8orf88P0DMB2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
C8orf88P0DMB2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C8orf88P0DMB2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C8orf88P0DMB2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C8orf88P0DMB2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C8orf88P0DMB2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C8orf88P0DMB2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C8orf88P0DMB2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C8orf88P0DMB2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C8orf88P0DMB2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C8orf88P0DMB2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C8orf88P0DMB2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C8orf88P0DMB2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C8orf88P0DMB2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C8orf88P0DMB2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C8orf88P0DMB2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C8orf88P0DMB2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C8orf88P0DMB2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C8orf88P0DMB2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
C8orf88P0DMB2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C8orf88P0DMB2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C8orf88P0DMB2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C8orf88P0DMB2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C8orf88P0DMB2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C8orf88P0DMB2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
C8orf88P0DMB2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C8orf88P0DMB2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C8orf88P0DMB2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C8orf88P0DMB2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C8orf88P0DMB2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C8orf88P0DMB2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C8orf88P0DMB2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C8orf88P0DMB2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms