Protein–RNA interactions for Protein: P0DJR0

GIMD1, GTPase IMAP family member GIMD1, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIMD1P0DJR0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GIMD1P0DJR0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GIMD1P0DJR0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GIMD1P0DJR0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GIMD1P0DJR0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GIMD1P0DJR0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GIMD1P0DJR0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GIMD1P0DJR0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GIMD1P0DJR0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GIMD1P0DJR0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GIMD1P0DJR0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GIMD1P0DJR0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GIMD1P0DJR0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GIMD1P0DJR0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GIMD1P0DJR0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GIMD1P0DJR0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GIMD1P0DJR0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GIMD1P0DJR0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GIMD1P0DJR0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GIMD1P0DJR0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GIMD1P0DJR0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
GIMD1P0DJR0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GIMD1P0DJR0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GIMD1P0DJR0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GIMD1P0DJR0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GIMD1P0DJR0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GIMD1P0DJR0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GIMD1P0DJR0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GIMD1P0DJR0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GIMD1P0DJR0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GIMD1P0DJR0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GIMD1P0DJR0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GIMD1P0DJR0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GIMD1P0DJR0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GIMD1P0DJR0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GIMD1P0DJR0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GIMD1P0DJR0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GIMD1P0DJR0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GIMD1P0DJR0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GIMD1P0DJR0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GIMD1P0DJR0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GIMD1P0DJR0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GIMD1P0DJR0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GIMD1P0DJR0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GIMD1P0DJR0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GIMD1P0DJR0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GIMD1P0DJR0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GIMD1P0DJR0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GIMD1P0DJR0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GIMD1P0DJR0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GIMD1P0DJR0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GIMD1P0DJR0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GIMD1P0DJR0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GIMD1P0DJR0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GIMD1P0DJR0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GIMD1P0DJR0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GIMD1P0DJR0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GIMD1P0DJR0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GIMD1P0DJR0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GIMD1P0DJR0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GIMD1P0DJR0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GIMD1P0DJR0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GIMD1P0DJR0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GIMD1P0DJR0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GIMD1P0DJR0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GIMD1P0DJR0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GIMD1P0DJR0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GIMD1P0DJR0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GIMD1P0DJR0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GIMD1P0DJR0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GIMD1P0DJR0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GIMD1P0DJR0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GIMD1P0DJR0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GIMD1P0DJR0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GIMD1P0DJR0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GIMD1P0DJR0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GIMD1P0DJR0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GIMD1P0DJR0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GIMD1P0DJR0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GIMD1P0DJR0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GIMD1P0DJR0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GIMD1P0DJR0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GIMD1P0DJR0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GIMD1P0DJR0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GIMD1P0DJR0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GIMD1P0DJR0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GIMD1P0DJR0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GIMD1P0DJR0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GIMD1P0DJR0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GIMD1P0DJR0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GIMD1P0DJR0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GIMD1P0DJR0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GIMD1P0DJR0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GIMD1P0DJR0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GIMD1P0DJR0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GIMD1P0DJR0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GIMD1P0DJR0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GIMD1P0DJR0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GIMD1P0DJR0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GIMD1P0DJR0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms