Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PNMA6AP0CW24 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PNMA6AP0CW24 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
PNMA6AP0CW24 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PNMA6AP0CW24 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PNMA6AP0CW24 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PNMA6AP0CW24 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PNMA6AP0CW24 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PNMA6AP0CW24 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PNMA6AP0CW24 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PNMA6AP0CW24 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PNMA6AP0CW24 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PNMA6AP0CW24 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PNMA6AP0CW24 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PNMA6AP0CW24 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PNMA6AP0CW24 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PNMA6AP0CW24 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PNMA6AP0CW24 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PNMA6AP0CW24 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PNMA6AP0CW24 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PNMA6AP0CW24 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PNMA6AP0CW24 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PNMA6AP0CW24 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PNMA6AP0CW24 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PNMA6AP0CW24 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PNMA6AP0CW24 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PNMA6AP0CW24 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PNMA6AP0CW24 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PNMA6AP0CW24 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PNMA6AP0CW24 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PNMA6AP0CW24 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PNMA6AP0CW24 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PNMA6AP0CW24 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PNMA6AP0CW24 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PNMA6AP0CW24 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PNMA6AP0CW24 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PNMA6AP0CW24 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PNMA6AP0CW24 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PNMA6AP0CW24 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PNMA6AP0CW24 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PNMA6AP0CW24 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PNMA6AP0CW24 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PNMA6AP0CW24 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PNMA6AP0CW24 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PNMA6AP0CW24 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PNMA6AP0CW24 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PNMA6AP0CW24 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PNMA6AP0CW24 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PNMA6AP0CW24 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PNMA6AP0CW24 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PNMA6AP0CW24 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PNMA6AP0CW24 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PNMA6AP0CW24 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PNMA6AP0CW24 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PNMA6AP0CW24 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PNMA6AP0CW24 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PNMA6AP0CW24 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PNMA6AP0CW24 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PNMA6AP0CW24 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PNMA6AP0CW24 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PNMA6AP0CW24 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PNMA6AP0CW24 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PNMA6AP0CW24 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PNMA6AP0CW24 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PNMA6AP0CW24 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PNMA6AP0CW24 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PNMA6AP0CW24 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PNMA6AP0CW24 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PNMA6AP0CW24 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PNMA6AP0CW24 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PNMA6AP0CW24 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PNMA6AP0CW24 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PNMA6AP0CW24 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PNMA6AP0CW24 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PNMA6AP0CW24 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PNMA6AP0CW24 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PNMA6AP0CW24 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PNMA6AP0CW24 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PNMA6AP0CW24 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PNMA6AP0CW24 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PNMA6AP0CW24 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PNMA6AP0CW24 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PNMA6AP0CW24 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PNMA6AP0CW24 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PNMA6AP0CW24 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PNMA6AP0CW24 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PNMA6AP0CW24 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PNMA6AP0CW24 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PNMA6AP0CW24 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PNMA6AP0CW24 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PNMA6AP0CW24 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PNMA6AP0CW24 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PNMA6AP0CW24 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PNMA6AP0CW24 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PNMA6AP0CW24 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PNMA6AP0CW24 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PNMA6AP0CW24 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PNMA6AP0CW24 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PNMA6AP0CW24 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PNMA6AP0CW24 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.5 ms