Protein–RNA interactions for Protein: P0CAP2

POLR2M, DNA-directed RNA polymerase II subunit GRINL1A, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2MP0CAP2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR2MP0CAP2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR2MP0CAP2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR2MP0CAP2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR2MP0CAP2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR2MP0CAP2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR2MP0CAP2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR2MP0CAP2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR2MP0CAP2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR2MP0CAP2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR2MP0CAP2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
POLR2MP0CAP2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLR2MP0CAP2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLR2MP0CAP2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLR2MP0CAP2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLR2MP0CAP2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
POLR2MP0CAP2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR2MP0CAP2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR2MP0CAP2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR2MP0CAP2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR2MP0CAP2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLR2MP0CAP2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLR2MP0CAP2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLR2MP0CAP2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLR2MP0CAP2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLR2MP0CAP2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR2MP0CAP2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR2MP0CAP2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR2MP0CAP2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR2MP0CAP2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR2MP0CAP2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR2MP0CAP2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR2MP0CAP2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR2MP0CAP2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLR2MP0CAP2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLR2MP0CAP2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLR2MP0CAP2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLR2MP0CAP2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLR2MP0CAP2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLR2MP0CAP2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLR2MP0CAP2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLR2MP0CAP2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
POLR2MP0CAP2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
POLR2MP0CAP2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
POLR2MP0CAP2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLR2MP0CAP2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLR2MP0CAP2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLR2MP0CAP2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLR2MP0CAP2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLR2MP0CAP2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLR2MP0CAP2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLR2MP0CAP2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLR2MP0CAP2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLR2MP0CAP2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLR2MP0CAP2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR2MP0CAP2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR2MP0CAP2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR2MP0CAP2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR2MP0CAP2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR2MP0CAP2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR2MP0CAP2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR2MP0CAP2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR2MP0CAP2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR2MP0CAP2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR2MP0CAP2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR2MP0CAP2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR2MP0CAP2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR2MP0CAP2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR2MP0CAP2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR2MP0CAP2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR2MP0CAP2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR2MP0CAP2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR2MP0CAP2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR2MP0CAP2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR2MP0CAP2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR2MP0CAP2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR2MP0CAP2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR2MP0CAP2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR2MP0CAP2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
POLR2MP0CAP2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
POLR2MP0CAP2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
POLR2MP0CAP2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
POLR2MP0CAP2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
POLR2MP0CAP2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLR2MP0CAP2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLR2MP0CAP2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
POLR2MP0CAP2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLR2MP0CAP2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLR2MP0CAP2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLR2MP0CAP2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLR2MP0CAP2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
POLR2MP0CAP2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR2MP0CAP2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR2MP0CAP2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR2MP0CAP2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR2MP0CAP2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR2MP0CAP2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLR2MP0CAP2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLR2MP0CAP2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLR2MP0CAP2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms