Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MMP3P08254 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MMP3P08254 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MMP3P08254 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MMP3P08254 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MMP3P08254 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MMP3P08254 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MMP3P08254 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MMP3P08254 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
MMP3P08254 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
MMP3P08254 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MMP3P08254 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MMP3P08254 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MMP3P08254 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MMP3P08254 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MMP3P08254 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MMP3P08254 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MMP3P08254 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MMP3P08254 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MMP3P08254 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MMP3P08254 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MMP3P08254 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MMP3P08254 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MMP3P08254 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MMP3P08254 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MMP3P08254 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
MMP3P08254 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MMP3P08254 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MMP3P08254 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MMP3P08254 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MMP3P08254 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MMP3P08254 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MMP3P08254 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MMP3P08254 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MMP3P08254 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MMP3P08254 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MMP3P08254 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MMP3P08254 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MMP3P08254 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MMP3P08254 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MMP3P08254 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MMP3P08254 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MMP3P08254 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MMP3P08254 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MMP3P08254 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MMP3P08254 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MMP3P08254 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MMP3P08254 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MMP3P08254 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MMP3P08254 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MMP3P08254 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MMP3P08254 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MMP3P08254 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MMP3P08254 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MMP3P08254 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
MMP3P08254 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MMP3P08254 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MMP3P08254 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MMP3P08254 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MMP3P08254 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MMP3P08254 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MMP3P08254 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MMP3P08254 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
MMP3P08254 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MMP3P08254 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MMP3P08254 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MMP3P08254 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MMP3P08254 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MMP3P08254 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MMP3P08254 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MMP3P08254 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MMP3P08254 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MMP3P08254 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MMP3P08254 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MMP3P08254 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MMP3P08254 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MMP3P08254 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
MMP3P08254 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MMP3P08254 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
MMP3P08254 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MMP3P08254 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MMP3P08254 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MMP3P08254 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MMP3P08254 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
MMP3P08254 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MMP3P08254 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MMP3P08254 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MMP3P08254 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MMP3P08254 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MMP3P08254 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MMP3P08254 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MMP3P08254 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MMP3P08254 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MMP3P08254 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MMP3P08254 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MMP3P08254 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MMP3P08254 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MMP3P08254 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MMP3P08254 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
MMP3P08254 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms