Protein–RNA interactions for Protein: P05937

CALB1, Calbindin, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB1P05937 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CALB1P05937 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CALB1P05937 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CALB1P05937 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CALB1P05937 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CALB1P05937 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CALB1P05937 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CALB1P05937 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CALB1P05937 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CALB1P05937 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CALB1P05937 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CALB1P05937 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CALB1P05937 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CALB1P05937 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CALB1P05937 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CALB1P05937 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CALB1P05937 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CALB1P05937 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CALB1P05937 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CALB1P05937 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CALB1P05937 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CALB1P05937 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CALB1P05937 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CALB1P05937 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALB1P05937 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALB1P05937 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALB1P05937 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALB1P05937 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CALB1P05937 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CALB1P05937 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CALB1P05937 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CALB1P05937 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CALB1P05937 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALB1P05937 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CALB1P05937 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CALB1P05937 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CALB1P05937 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CALB1P05937 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CALB1P05937 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CALB1P05937 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CALB1P05937 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CALB1P05937 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CALB1P05937 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CALB1P05937 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CALB1P05937 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CALB1P05937 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CALB1P05937 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CALB1P05937 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CALB1P05937 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CALB1P05937 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALB1P05937 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALB1P05937 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALB1P05937 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CALB1P05937 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CALB1P05937 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CALB1P05937 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CALB1P05937 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CALB1P05937 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CALB1P05937 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CALB1P05937 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CALB1P05937 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CALB1P05937 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CALB1P05937 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CALB1P05937 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CALB1P05937 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CALB1P05937 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CALB1P05937 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CALB1P05937 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CALB1P05937 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CALB1P05937 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CALB1P05937 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CALB1P05937 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CALB1P05937 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CALB1P05937 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CALB1P05937 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CALB1P05937 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CALB1P05937 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CALB1P05937 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CALB1P05937 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CALB1P05937 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CALB1P05937 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CALB1P05937 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CALB1P05937 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CALB1P05937 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CALB1P05937 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CALB1P05937 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CALB1P05937 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CALB1P05937 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CALB1P05937 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CALB1P05937 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CALB1P05937 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CALB1P05937 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CALB1P05937 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CALB1P05937 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CALB1P05937 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CALB1P05937 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CALB1P05937 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CALB1P05937 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CALB1P05937 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CALB1P05937 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms