Protein–RNA interactions for Protein: P05026

ATP1B1, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B1P05026 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP1B1P05026 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP1B1P05026 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP1B1P05026 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP1B1P05026 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP1B1P05026 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP1B1P05026 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP1B1P05026 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP1B1P05026 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP1B1P05026 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP1B1P05026 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP1B1P05026 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP1B1P05026 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP1B1P05026 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP1B1P05026 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP1B1P05026 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP1B1P05026 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP1B1P05026 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP1B1P05026 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP1B1P05026 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP1B1P05026 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP1B1P05026 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP1B1P05026 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP1B1P05026 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP1B1P05026 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP1B1P05026 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP1B1P05026 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP1B1P05026 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP1B1P05026 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP1B1P05026 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP1B1P05026 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP1B1P05026 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP1B1P05026 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP1B1P05026 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP1B1P05026 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP1B1P05026 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP1B1P05026 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP1B1P05026 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP1B1P05026 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP1B1P05026 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP1B1P05026 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP1B1P05026 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP1B1P05026 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP1B1P05026 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP1B1P05026 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP1B1P05026 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP1B1P05026 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP1B1P05026 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP1B1P05026 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP1B1P05026 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP1B1P05026 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP1B1P05026 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP1B1P05026 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP1B1P05026 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP1B1P05026 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP1B1P05026 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP1B1P05026 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP1B1P05026 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP1B1P05026 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP1B1P05026 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP1B1P05026 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP1B1P05026 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP1B1P05026 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP1B1P05026 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP1B1P05026 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP1B1P05026 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP1B1P05026 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP1B1P05026 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP1B1P05026 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP1B1P05026 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP1B1P05026 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP1B1P05026 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP1B1P05026 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP1B1P05026 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP1B1P05026 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP1B1P05026 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP1B1P05026 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP1B1P05026 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP1B1P05026 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP1B1P05026 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP1B1P05026 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP1B1P05026 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP1B1P05026 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP1B1P05026 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP1B1P05026 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP1B1P05026 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP1B1P05026 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP1B1P05026 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP1B1P05026 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP1B1P05026 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP1B1P05026 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP1B1P05026 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP1B1P05026 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP1B1P05026 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP1B1P05026 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP1B1P05026 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP1B1P05026 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP1B1P05026 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP1B1P05026 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP1B1P05026 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms