Protein–RNA interactions for Protein: P04843

RPN1, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN1P04843 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RPN1P04843 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RPN1P04843 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RPN1P04843 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RPN1P04843 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RPN1P04843 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RPN1P04843 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RPN1P04843 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RPN1P04843 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RPN1P04843 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RPN1P04843 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RPN1P04843 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
RPN1P04843 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RPN1P04843 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RPN1P04843 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RPN1P04843 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RPN1P04843 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RPN1P04843 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RPN1P04843 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RPN1P04843 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RPN1P04843 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.51■■■□□ 2
RPN1P04843 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPN1P04843 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPN1P04843 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPN1P04843 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPN1P04843 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPN1P04843 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPN1P04843 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPN1P04843 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPN1P04843 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPN1P04843 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPN1P04843 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPN1P04843 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPN1P04843 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPN1P04843 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPN1P04843 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPN1P04843 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RPN1P04843 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RPN1P04843 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPN1P04843 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPN1P04843 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RPN1P04843 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPN1P04843 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPN1P04843 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPN1P04843 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPN1P04843 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPN1P04843 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPN1P04843 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPN1P04843 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPN1P04843 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPN1P04843 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPN1P04843 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPN1P04843 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPN1P04843 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPN1P04843 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPN1P04843 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RPN1P04843 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RPN1P04843 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RPN1P04843 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPN1P04843 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPN1P04843 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPN1P04843 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPN1P04843 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPN1P04843 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPN1P04843 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RPN1P04843 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RPN1P04843 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPN1P04843 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPN1P04843 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPN1P04843 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPN1P04843 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPN1P04843 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPN1P04843 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPN1P04843 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RPN1P04843 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPN1P04843 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPN1P04843 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPN1P04843 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPN1P04843 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPN1P04843 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPN1P04843 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPN1P04843 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPN1P04843 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPN1P04843 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPN1P04843 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
RPN1P04843 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
RPN1P04843 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPN1P04843 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPN1P04843 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPN1P04843 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RPN1P04843 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPN1P04843 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPN1P04843 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPN1P04843 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPN1P04843 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPN1P04843 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPN1P04843 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPN1P04843 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPN1P04843 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPN1P04843 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 590.9 ms