Protein–RNA interactions for Protein: O96019

ACTL6A, Actin-like protein 6A, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTL6AO96019 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTL6AO96019 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTL6AO96019 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTL6AO96019 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTL6AO96019 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTL6AO96019 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTL6AO96019 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTL6AO96019 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTL6AO96019 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACTL6AO96019 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTL6AO96019 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTL6AO96019 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTL6AO96019 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTL6AO96019 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTL6AO96019 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTL6AO96019 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTL6AO96019 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTL6AO96019 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTL6AO96019 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTL6AO96019 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTL6AO96019 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTL6AO96019 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTL6AO96019 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTL6AO96019 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTL6AO96019 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTL6AO96019 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTL6AO96019 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTL6AO96019 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTL6AO96019 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTL6AO96019 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTL6AO96019 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTL6AO96019 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTL6AO96019 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTL6AO96019 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTL6AO96019 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTL6AO96019 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTL6AO96019 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ACTL6AO96019 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTL6AO96019 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTL6AO96019 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTL6AO96019 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTL6AO96019 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTL6AO96019 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTL6AO96019 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTL6AO96019 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTL6AO96019 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTL6AO96019 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTL6AO96019 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTL6AO96019 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTL6AO96019 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTL6AO96019 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTL6AO96019 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTL6AO96019 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTL6AO96019 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTL6AO96019 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTL6AO96019 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTL6AO96019 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTL6AO96019 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTL6AO96019 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTL6AO96019 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTL6AO96019 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTL6AO96019 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTL6AO96019 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTL6AO96019 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTL6AO96019 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTL6AO96019 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTL6AO96019 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTL6AO96019 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTL6AO96019 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTL6AO96019 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTL6AO96019 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTL6AO96019 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTL6AO96019 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTL6AO96019 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTL6AO96019 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTL6AO96019 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTL6AO96019 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTL6AO96019 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTL6AO96019 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTL6AO96019 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTL6AO96019 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTL6AO96019 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTL6AO96019 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTL6AO96019 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTL6AO96019 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTL6AO96019 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTL6AO96019 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTL6AO96019 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTL6AO96019 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTL6AO96019 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTL6AO96019 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTL6AO96019 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTL6AO96019 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTL6AO96019 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTL6AO96019 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTL6AO96019 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTL6AO96019 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTL6AO96019 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTL6AO96019 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTL6AO96019 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms