Protein–RNA interactions for Protein: O95696

BRD1, Bromodomain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD1O95696 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BRD1O95696 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BRD1O95696 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BRD1O95696 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BRD1O95696 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BRD1O95696 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BRD1O95696 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BRD1O95696 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BRD1O95696 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BRD1O95696 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BRD1O95696 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
BRD1O95696 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BRD1O95696 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BRD1O95696 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
BRD1O95696 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BRD1O95696 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BRD1O95696 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BRD1O95696 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BRD1O95696 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BRD1O95696 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BRD1O95696 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BRD1O95696 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BRD1O95696 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BRD1O95696 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BRD1O95696 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BRD1O95696 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BRD1O95696 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BRD1O95696 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
BRD1O95696 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
BRD1O95696 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
BRD1O95696 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
BRD1O95696 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
BRD1O95696 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BRD1O95696 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BRD1O95696 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BRD1O95696 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BRD1O95696 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BRD1O95696 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BRD1O95696 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BRD1O95696 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
BRD1O95696 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BRD1O95696 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BRD1O95696 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BRD1O95696 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BRD1O95696 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BRD1O95696 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BRD1O95696 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BRD1O95696 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BRD1O95696 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BRD1O95696 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BRD1O95696 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
BRD1O95696 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BRD1O95696 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BRD1O95696 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BRD1O95696 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BRD1O95696 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BRD1O95696 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BRD1O95696 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BRD1O95696 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BRD1O95696 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BRD1O95696 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BRD1O95696 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BRD1O95696 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BRD1O95696 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BRD1O95696 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BRD1O95696 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BRD1O95696 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BRD1O95696 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
BRD1O95696 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
BRD1O95696 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BRD1O95696 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
BRD1O95696 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BRD1O95696 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BRD1O95696 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BRD1O95696 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BRD1O95696 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BRD1O95696 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BRD1O95696 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BRD1O95696 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BRD1O95696 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BRD1O95696 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BRD1O95696 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BRD1O95696 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BRD1O95696 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BRD1O95696 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BRD1O95696 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BRD1O95696 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BRD1O95696 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BRD1O95696 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BRD1O95696 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
BRD1O95696 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BRD1O95696 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
BRD1O95696 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
BRD1O95696 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BRD1O95696 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
BRD1O95696 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
BRD1O95696 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
BRD1O95696 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BRD1O95696 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BRD1O95696 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms