Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SFT2D2O95562 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFT2D2O95562 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFT2D2O95562 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFT2D2O95562 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFT2D2O95562 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFT2D2O95562 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFT2D2O95562 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SFT2D2O95562 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFT2D2O95562 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFT2D2O95562 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFT2D2O95562 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFT2D2O95562 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFT2D2O95562 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFT2D2O95562 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFT2D2O95562 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFT2D2O95562 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFT2D2O95562 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFT2D2O95562 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFT2D2O95562 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFT2D2O95562 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFT2D2O95562 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFT2D2O95562 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SFT2D2O95562 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFT2D2O95562 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFT2D2O95562 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFT2D2O95562 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFT2D2O95562 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFT2D2O95562 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFT2D2O95562 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFT2D2O95562 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFT2D2O95562 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFT2D2O95562 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFT2D2O95562 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFT2D2O95562 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SFT2D2O95562 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFT2D2O95562 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SFT2D2O95562 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SFT2D2O95562 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SFT2D2O95562 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SFT2D2O95562 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SFT2D2O95562 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
SFT2D2O95562 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFT2D2O95562 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFT2D2O95562 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFT2D2O95562 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFT2D2O95562 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFT2D2O95562 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFT2D2O95562 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFT2D2O95562 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFT2D2O95562 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFT2D2O95562 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFT2D2O95562 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFT2D2O95562 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SFT2D2O95562 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFT2D2O95562 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFT2D2O95562 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFT2D2O95562 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFT2D2O95562 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFT2D2O95562 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFT2D2O95562 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFT2D2O95562 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFT2D2O95562 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SFT2D2O95562 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFT2D2O95562 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFT2D2O95562 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFT2D2O95562 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFT2D2O95562 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFT2D2O95562 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFT2D2O95562 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFT2D2O95562 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SFT2D2O95562 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SFT2D2O95562 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SFT2D2O95562 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SFT2D2O95562 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFT2D2O95562 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFT2D2O95562 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SFT2D2O95562 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFT2D2O95562 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFT2D2O95562 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFT2D2O95562 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFT2D2O95562 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFT2D2O95562 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFT2D2O95562 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFT2D2O95562 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFT2D2O95562 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFT2D2O95562 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFT2D2O95562 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFT2D2O95562 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFT2D2O95562 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFT2D2O95562 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFT2D2O95562 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFT2D2O95562 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFT2D2O95562 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFT2D2O95562 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFT2D2O95562 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFT2D2O95562 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFT2D2O95562 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SFT2D2O95562 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFT2D2O95562 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms