Protein–RNA interactions for Protein: O95455

TGDS, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGDSO95455 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TGDSO95455 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TGDSO95455 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TGDSO95455 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TGDSO95455 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TGDSO95455 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TGDSO95455 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TGDSO95455 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TGDSO95455 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TGDSO95455 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TGDSO95455 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TGDSO95455 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TGDSO95455 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TGDSO95455 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TGDSO95455 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TGDSO95455 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TGDSO95455 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TGDSO95455 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TGDSO95455 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TGDSO95455 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TGDSO95455 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TGDSO95455 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TGDSO95455 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TGDSO95455 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TGDSO95455 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TGDSO95455 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TGDSO95455 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TGDSO95455 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TGDSO95455 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TGDSO95455 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TGDSO95455 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TGDSO95455 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TGDSO95455 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TGDSO95455 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TGDSO95455 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TGDSO95455 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TGDSO95455 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TGDSO95455 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TGDSO95455 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TGDSO95455 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TGDSO95455 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TGDSO95455 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TGDSO95455 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TGDSO95455 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TGDSO95455 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TGDSO95455 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TGDSO95455 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TGDSO95455 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TGDSO95455 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TGDSO95455 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TGDSO95455 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TGDSO95455 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TGDSO95455 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TGDSO95455 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TGDSO95455 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TGDSO95455 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TGDSO95455 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TGDSO95455 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TGDSO95455 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TGDSO95455 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TGDSO95455 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TGDSO95455 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TGDSO95455 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TGDSO95455 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TGDSO95455 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TGDSO95455 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TGDSO95455 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TGDSO95455 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TGDSO95455 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TGDSO95455 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TGDSO95455 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TGDSO95455 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TGDSO95455 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TGDSO95455 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TGDSO95455 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TGDSO95455 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TGDSO95455 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TGDSO95455 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TGDSO95455 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TGDSO95455 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TGDSO95455 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TGDSO95455 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TGDSO95455 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TGDSO95455 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TGDSO95455 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TGDSO95455 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TGDSO95455 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TGDSO95455 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TGDSO95455 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TGDSO95455 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TGDSO95455 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TGDSO95455 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TGDSO95455 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TGDSO95455 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TGDSO95455 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TGDSO95455 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TGDSO95455 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TGDSO95455 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TGDSO95455 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TGDSO95455 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms