Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNAPINO95295 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNAPINO95295 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNAPINO95295 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNAPINO95295 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNAPINO95295 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNAPINO95295 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNAPINO95295 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNAPINO95295 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNAPINO95295 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNAPINO95295 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNAPINO95295 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNAPINO95295 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNAPINO95295 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNAPINO95295 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNAPINO95295 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNAPINO95295 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNAPINO95295 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNAPINO95295 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNAPINO95295 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNAPINO95295 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNAPINO95295 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNAPINO95295 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNAPINO95295 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNAPINO95295 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNAPINO95295 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNAPINO95295 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNAPINO95295 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNAPINO95295 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNAPINO95295 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNAPINO95295 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNAPINO95295 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNAPINO95295 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNAPINO95295 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNAPINO95295 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNAPINO95295 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNAPINO95295 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNAPINO95295 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNAPINO95295 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNAPINO95295 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNAPINO95295 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNAPINO95295 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNAPINO95295 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNAPINO95295 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNAPINO95295 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNAPINO95295 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNAPINO95295 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SNAPINO95295 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SNAPINO95295 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SNAPINO95295 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SNAPINO95295 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNAPINO95295 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNAPINO95295 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNAPINO95295 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNAPINO95295 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNAPINO95295 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNAPINO95295 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNAPINO95295 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNAPINO95295 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNAPINO95295 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNAPINO95295 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNAPINO95295 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SNAPINO95295 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNAPINO95295 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SNAPINO95295 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNAPINO95295 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNAPINO95295 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNAPINO95295 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNAPINO95295 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNAPINO95295 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNAPINO95295 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAPINO95295 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAPINO95295 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAPINO95295 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAPINO95295 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAPINO95295 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAPINO95295 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAPINO95295 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAPINO95295 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAPINO95295 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAPINO95295 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAPINO95295 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAPINO95295 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAPINO95295 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAPINO95295 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAPINO95295 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAPINO95295 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAPINO95295 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAPINO95295 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAPINO95295 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAPINO95295 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNAPINO95295 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNAPINO95295 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNAPINO95295 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNAPINO95295 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNAPINO95295 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNAPINO95295 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNAPINO95295 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNAPINO95295 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNAPINO95295 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms