Protein–RNA interactions for Protein: O94906

PRPF6, Pre-mRNA-processing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF6O94906 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PRPF6O94906 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRPF6O94906 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRPF6O94906 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRPF6O94906 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRPF6O94906 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRPF6O94906 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRPF6O94906 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRPF6O94906 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRPF6O94906 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRPF6O94906 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRPF6O94906 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRPF6O94906 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRPF6O94906 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PRPF6O94906 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRPF6O94906 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRPF6O94906 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRPF6O94906 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRPF6O94906 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRPF6O94906 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRPF6O94906 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRPF6O94906 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRPF6O94906 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRPF6O94906 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRPF6O94906 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRPF6O94906 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRPF6O94906 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRPF6O94906 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRPF6O94906 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRPF6O94906 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRPF6O94906 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRPF6O94906 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRPF6O94906 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRPF6O94906 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRPF6O94906 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRPF6O94906 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRPF6O94906 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRPF6O94906 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRPF6O94906 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRPF6O94906 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRPF6O94906 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRPF6O94906 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRPF6O94906 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRPF6O94906 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRPF6O94906 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRPF6O94906 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRPF6O94906 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRPF6O94906 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRPF6O94906 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRPF6O94906 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRPF6O94906 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRPF6O94906 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRPF6O94906 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRPF6O94906 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRPF6O94906 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRPF6O94906 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRPF6O94906 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRPF6O94906 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRPF6O94906 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRPF6O94906 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRPF6O94906 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRPF6O94906 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRPF6O94906 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRPF6O94906 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRPF6O94906 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRPF6O94906 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRPF6O94906 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRPF6O94906 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRPF6O94906 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRPF6O94906 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRPF6O94906 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRPF6O94906 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRPF6O94906 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRPF6O94906 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRPF6O94906 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRPF6O94906 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
PRPF6O94906 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
PRPF6O94906 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRPF6O94906 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRPF6O94906 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRPF6O94906 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRPF6O94906 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRPF6O94906 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PRPF6O94906 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRPF6O94906 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PRPF6O94906 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRPF6O94906 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRPF6O94906 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRPF6O94906 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRPF6O94906 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRPF6O94906 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRPF6O94906 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRPF6O94906 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRPF6O94906 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRPF6O94906 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRPF6O94906 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRPF6O94906 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRPF6O94906 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRPF6O94906 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRPF6O94906 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.1 ms